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ゲル電気泳動とSDS PAGEの違い

主な違い ゲル電気泳動と SDS PAGE の違いは、ゲル電気泳動は DNA、RNA、タンパク質の分離に使用される技術であるのに対し、SDS PAGE は主にタンパク質の分離に使用されるゲル電気泳動の一種です。 一般に、SDS PAGE は通常のゲル電気泳動よりも優れた分解能を示します。

ゲル電気泳動と SDS PAGE は、電荷とサイズに基づいて高分子を分離するのに役立つバイオテクノロジーの技術です。通常、ゲル電気泳動では分離にアガロース ゲル刺しを使用しますが、SDS PAGE ではポリアクリルアミド ゲル刺しを使用します。

対象となる主な分野

1.ゲル電気泳動とは
定義、手順、重要性
2. SDS ページとは
定義、手順、重要性
3.ゲル電気泳動と SDS PAGE の類似点
– 共通機能の概要
4.ゲル電気泳動と SDS PAGE の違いは何ですか
主な相違点の比較

重要な用語:アガロース、DNA、ゲル電気泳動、ポリアクリルアミド、タンパク質、SDS PAGE

ゲル電気泳動とは

ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの高分子の断片を、そのサイズと電荷に基づいて分離する技術です。ゲル電気泳動中、巨大分子は、巨大分子が移動する細孔を含むゲルマトリックス上の電場の影響下で移動します。ゲル電気泳動は、PCR、RFLP、クローニング、DNA 配列決定、またはブロッティング技術から DNA を分析する一般的な技術です。ナノ粒子は、ゲル電気泳動によって分離することもできます。ゲル刺しは、海藻由来のアガロースと呼ばれる多糖類から調製されます。アガロースゲルは、蜘蛛の巣のように連結した長鎖アガロース分子で構成されています。 ビデオ 1 アガロースゲルの調製について説明します。

DNA と RNA の両方が、それぞれのモノマー ヌクレオチドにリン酸基を含んでいます。したがって、それらは分子全体で等しい負電荷を持っています。さらに、それらは電界下で正極に向かって移動します。移動速度は核酸のサイズに依存します。短い分子は細孔を通ってより速く移動しますが、大きい分子は少し時間がかかります。

図 1:アガロースゲル上の DNA バンド

SDS PAGEとは

SDS PAGE(ドデシル硫酸ナトリウム - ポリアクリルアミドゲル電気泳動) は、サイズに基づいて荷電分子を分離するために使用される分析技術です。このプロセスでは、SDS を使用してタンパク質を変性させて分離します。 SDS は洗剤です。それによってタンパク質の三次構造が破壊され、折り畳まれたタンパク質が直鎖状の分子になります。また、その線形タンパク質分子を均一な負電荷でコーティングします。 SDS PAGE は、濃度の異なる 2 つのゲルで構成されています。最上層はサンプルがロードされるスタッキングゲルと呼ばれ、最下層は分解ゲルと呼ばれます。スタッキングゲルのポリアクリルアミド濃度は 3.5 ~ 4% (ポアサイズが大きい) で、タンパク質を 1 つのバンドに濃縮します。分離ゲル中のポリアクリルアミド濃度は 4 ~ 20% (細孔サイズが小さい) で、サイズに基づいてタンパク質を分離します。 ビデオ 2 SDS PAGE の準備を示します。

SDS PAGE はタンパク質の迅速な分離を提供し、ウェスタンブロッティングなどのその後の分析を支援します。

図 2:SDS PAGE のタンパク質バンド

SDS PAGE の分解能は通常のアガロース ゲルよりも高いため、SDS PAGE はサイズが 5 ~ 500 bp の小さな DNA 断片を分離するのに役立ちます。

ゲル電気泳動と SDS PAGE の類似点

  • ゲル電気泳動と SDS PAGE は、高分子をその電荷とサイズに基づいて分離する技術です。
  • どちらの手法も、高分子が移動する小さな孔のあるゲル刺し傷を使用します。
  • 駆動力は、2 つの電極間の電位差です。

ゲル電気泳動と SDS PAGE の違い

定義

ゲル電気泳動: サイズと電荷に基づいて、DNA、RNA、タンパク質などの高分子の断片を分離するために使用される技術

SDS ページ: サイズに基づいて荷電分子を分離するために使用される分析技術

構成

ゲル電気泳動: ゲル全体で均等。アガロースからなる

SDS ページ: 異なる濃度の 2 つのゲル。ポリアクリルアミドからなる

実行構成

ゲル電気泳動: 水平ラン

SDS ページ: 垂直ラン

キャスティング方法

ゲル電気泳動: 冷めると固まる

SDS ページ: 化学反応で固まる

毛穴のサイズ

ゲル電気泳動: 細孔サイズは均一ではありません。アガロース濃度が高いほど、ポアサイズは小さくなります

SDS ページ: 細孔サイズは均一です。アクリルアミドとビスアクリルアミドの比率が孔径を決定します

集中

ゲル電気泳動: 0.5-2%

SDS ページ: 6-15%

分離

ゲル電気泳動: 50~20,000 bp の核酸

SDS ページ: 5-250,000 Da タンパク質

条件

ゲル電気泳動: 通常、ネイティブ条件下で実行

SDS ページ: 変性条件

準備

ゲル電気泳動: シンプル

SDS ページ: 複雑なプロセス

染色

ゲル電気泳動: 臭化エチジウム使用

SDS ページ: クマシー染色または銀染色

結論

ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの高分子をサイズに基づいて分離する分析技術です。 SDS PAGE は、変性条件下でタンパク質を分離するために主に使用されるゲル電気泳動の一種です。 SDS PAGE は、通常のゲル電気泳動に比べて分解能が高くなります。ゲル電気泳動と SDS PAGE の主な違いは、分離する高分子の種類とその手順です。

参照:

1. "ゲル電気泳動。"カーン アカデミー、こちらから入手できます
2. 「SDSポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)」。 Diamantina Institute、2017 年 4 月 26 日、こちらから入手可能

画像提供:

1. 「ゲル電気泳動 2」Von Mnolf – オーストリアのインスブルックで撮影された写真 (CC BY-SA 3.0)、Commons Wikimedia 経由
2. 「Coomassie3」Yikrazuul 著 – Commons Wikimedia 経由の自身の作品(CC BY-SA 3.0)


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