主な違い プロテオミクスとトランスクリプトミクスの間にあるのは、プロテオミクスは特定の生物によって生成されるタンパク質のセット全体の研究であるのに対し、トランスクリプトミクスは特定の生物によって合成される mRNA のセット全体の研究です。 .
プロテオミクスとトランスクリプトミクスは、特定の生物の遺伝子発現が研究される 2 つの分野です。
対象となる主な分野
1.プロテオミクスとは
– 定義、事実、適用
2.トランスクリプトミクスとは
– 定義、事実、適用
3.プロテオミクスとトランスクリプトミクスの類似点は何ですか
– 共通機能の概要
4.プロテオミクスとトランスクリプトミクスの違いは何ですか
– 主な違いの比較
主な用語
アプリケーション、mRNA、タンパク質、プロテオミクス、テクニック、トランスクリプトミクス
プロテオミクスとは
プロテオミクスは、プロテオームの大規模研究です。プロテオームとは、特定の生物または細胞によって産生されるタンパク質のセット全体を指します。したがって、特定の種類の生物または細胞には、固有のプロテオームがあります。プロテオミクスの主な研究分野は次のとおりです。
- タンパク質の 3D 構造予測;
- タンパク質合成の場所と時間の検出;
- タンパク質の生産速度、分解速度、および定常状態の存在量;
- 翻訳後修飾などのタンパク質修飾;
- 細胞内コンパートメント間のタンパク質輸送;
- 代謝経路におけるタンパク質の関与;
- タンパク質同士の相互作用。
図 1:PDB から入手できるタンパク質構造の例
質量分析やゲル電気泳動の違い (DIGE) など、いくつかのハイスループット技術がプロテオミクス研究に関与しています。
トランスクリプトミクスとは
トランスクリプトミクスは、特定の生物または細胞のトランスクリプトームに関する研究です。トランスクリプトームとは、生物または細胞内のmRNAのセット全体を指します。ただし、RNA のセット全体を指す場合もあります。トランスクリプトームは、生物または細胞が直面する環境条件によって異なります。したがって、特定の条件下で定義された時間に発現した一連の RNA を反映します。トランスクリプトミクスには、発現プロファイリングとスライスバリアント分析の両方の調査が含まれます。 DNA マイクロアレイと RNA Seq は、トランスクリプトミクスで使用される 2 つの主要な技術です。
図 2:マイクロアレイと RNA 配列
プロテオミクスとトランスクリプトミクスの類似点
- プロテオミクスとトランスクリプトミクスは、特定の生物または細胞の種類の遺伝子発現を研究する 2 種類の分野です。
- ハイスループット技術は、プロテオミクスとトランスクリプトミクスの両方で使用されます。
プロテオミクスとトランスクリプトミクスの違い
定義
プロテオミクスはプロテオームとその機能の研究を指し、トランスクリプトームはトランスクリプトームとその機能の研究を指します.
研究の種類
プロテオミクスは発現するタンパク質のセット全体を研究し、トランスクリプトミクスは特定の生物で発現する mRNA のセット全体を研究します。
現象
プロテオミクスは、タンパク質の 3D 構造と機能、タンパク質間相互作用を研究し、トランスクリプトミクスは配列構造、環境との相互作用、mRNA の応用を研究します。
テクニック
プロテオミクスには質量分析と差分ゲル電気泳動（DIGE）が含まれ、トランスクリプトミクスには技術として DNA マイクロアレイと RNA Seq が含まれます。
重要な分野
プロテオミクスの重要な分野のいくつかは、SWISS-2DPAGE などのプロテオーム データベースの開発とコンピューター支援による創薬のためのソフトウェア開発であり、トランスクリプトミクスは細胞分化、発癌、初期胚発生を制御する分子メカニズムとシグナル伝達経路を、薬物または化学物質のリスク評価のためのバイオマーカーとして、また個体間の系統関係を推測する。
結論
プロテオミクスは、特定の生物のタンパク質のセット全体の研究であり、トランスクリプトミクスは生物の mRNA のセット全体の研究です。したがって、プロテオミクスとトランスクリプトミクスの主な違いは研究の種類です。
参照:
1.「プロテオミクスとは？」 Proteomics:An Introduction to EMBL-EBI Resources、2016 年 6 月 8 日、こちらから入手可能
2.ロウ、ローハン等。 「トランスクリプトミクス技術」。 PLoS 計算生物学 13.5 (2017):e1005457。 PMC。ウェブ。 2018 年 7 月 10 日、こちらから入手可能
画像提供:
1. 「タンパク質構造の例」 Axel Griewel 著 – 自作 (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia 経由
2. 「マイクロアレイとシーケンシング フロー セル」Thomas Shafee 著 – 自作 (CC BY 4.0) Commons Wikimedia 経由
