表現されたシーケンス タグとシーケンス アノテーションの主な違い 発現配列タグ (EST) は、遺伝子の確認に重要な完全または部分的な cDNA 配列であるのに対し、配列注釈は、遺伝子の構造的および機能的構成要素を導き出すことです。
一般に、発現された配列タグと配列注釈は、ゲノムの構造部分と機能部分を決定するための 2 つの重要な事実です。
主な用語
表現された配列タグ、配列注釈 
Expressed Sequence タグとは
発現配列タグ (EST) は、新しい遺伝子を決定する際に重要な短い cDNA 配列です。これらの発現配列タグは、遺伝子転写産物を識別するためにも重要です。発現配列タグの需要は、全ゲノムおよびトランスクリプトーム シーケンス内で高くなります。 EST は、クローン化された cDNA のワンショット シーケンスから得られます。一般に、EST 生成用の cDNA は、cDNA ライブラリーの単一クローンからのものです。さらに、ESTは発現遺伝子の一部を表します。それらは 500 ～ 800 bp の長さの配列でもあります。
図 1:cDNA ライブラリ
さらに、特定の染色体の配列タグは、放射線ハイブリッド マッピング、ハッピー マッピング、または FISH などの物理マッピング技術によって表現されます。さらに、ESTは新しい遺伝子の配列と整列して、新しい遺伝子配列が遺伝子を表すことを確認します。一般に、これは予測された転写産物から遺伝子を同定するためのツールです。
Sequence Annotation とは
配列注釈は、ゲノム内の遺伝子または遺伝子のコード領域の位置を特定するプロセスです。配列が決定されると、ゲノムのアノテーションは、ゲノムの構造と機能を識別するために重要です。アノテーションの後、ゲノムは、イントロンとエクソンの境界、調節配列、反復、遺伝子名、およびタンパク質産物に対するゲノム位置で知られています。したがって、配列アノテーションにより、ゲノムに沿った機能要素の識別が可能になります。
図 2:遺伝子構造
さらに、過去 30 年間で、配列アノテーションは 2 つの側面で進化しました:単一ゲノム上の長いタンパク質コード遺伝子のコンピューターによるアノテーションと、短い調節要素の実験的アノテーションです。ただし、配列アノテーションは、配列の構造および機能情報を導き出すプロセスです。
表現された配列タグと配列注釈の間の類似点
- 発現配列タグと配列注釈は、ゲノムの構造部分と機能部分を特定する上で重要な 2 つの要素です。
- さらに、どちらもゲノムの要素をマークするのに役立ちます。
表現されたシーケンス タグとシーケンス アノテーションの違い
定義
発現配列タグ (EST) は短い (200 ～ 500 ヌクレオチド) の cDNA 配列を指し、配列の注釈を付ける際に特定の時間に細胞内で発現する遺伝子を識別するために重要です。構造または機能に関する説明情報を使用して、DNA、RNA、またはタンパク質配列の特定の特徴をマークするプロセスを指します。
意義
通常、発現配列タグは遺伝子の同定に使用される短い cDNA 配列であり、配列注釈は特定の構造と機能について DNA をマークするプロセスです。
機能
発現配列タグは、ゲノム内の新しい遺伝子を識別するために重要ですが、配列アノテーションは、ゲノム内の DNA に遺伝子をマークするプロセスです。
結論
簡単に言うと、発現配列タグと配列注釈は、ゲノムの構造部分と機能部分を決定する際の 2 つの重要な要素です。発現配列タグは、ゲノム内の新しい遺伝子配列を確認するのに役立つ短いcDNA配列であり、配列注釈は、ゲノムの構造および機能部分をマークするプロセスです。たとえば、EST はゲノム内の新しい遺伝子を決定するのに役立ちます。ただし、発現配列タグと配列アノテーションの主な違いは、ゲノム内での機能です。
