人口と経済成長に伴う気候変動と食料需要の増加は、農業にとって大きな課題です。米は、特にアジアにおいて、多くの人々の食生活に貢献する最も重要な食用作物の 1 つです。
米（イネ ）は何千年も前にアジアで家畜化され、最近ではアフリカで独立して家畜化されました。野生のイネの個体群は、熱帯の世界で見られます。多くの地域での米の大規模な生産は、人間による最初の家畜化の基礎であった野生の個体群を追い出しました.最近の研究では、アジアでの栽培化の影響から隔離されたオーストラリア北部の野生稲が特定されました。
DNA 配列決定技術の進歩により、多数の個人のゲノムを解析できるようになりました。これは、人間の遺伝学だけでなく、生物学、特に生物多様性の分析にも大きな影響を与えてきました。野生イネ個体群の DNA 配列は、個体群の多様性、異なる個体群間の関係、および人間による家畜化に至る進化上の出来事について多くを明らかにしました。
葉緑体ゲノムの配列は、植物の進化的関係を決定するために広く使用されてきました。このアプローチの利点には、葉緑体の高度に保存された性質が含まれており、植物内の同じ配列を直接比較することが難しくなく、比較するためのかなりの量の DNA 配列が提供されます。栽培化されたイネと密接に関連している野生イネの葉緑体配列の比較により、イネの栽培化につながるイベントが定義されました。
約 300 万年前、栽培化されたイネの祖先であり、栽培化されたイネと今でも交配可能な野生イネの個体群の分岐により、Oryza meredionalis となった系統が生まれました。 、Oryza rufipogon につながるものから分離してオーストラリアで見つかった種 、アジアで見られるワイルドライス。核ゲノムの分析により、オーストラリアの Oryza rufipogon の個体群は、 約170万年前にアジアから分岐した。イネの一次遺伝子プールにおけるアジアとアフリカの野生イネの相違は、より最近のものであることが示されました。 58の遺伝子型の全葉緑体ゲノムの現在の調査は、明確なオーストラリアのクレードが北のフィリピンまで広がっていることを示しました
現代の栽培イネは、インディカ、ジャポニカ、およびオースタイプを含むいくつかのタイプに分けることができます.インディカとジャポニカのタイプは、野生個体群の異なる葉緑体配列に対応しており、別々の家畜化イベントでこれらが捕獲されたことを示しています。 aus 型には、より複雑な遺伝的起源を示す野生型の葉緑体型を持つ個体が含まれることが判明しました。
この研究では、Oryza glumipatula の葉緑体配列間の密接な関係も確認されました。 南アメリカとオリザ・ロンギスタミナータ 南アフリカで。これは、比較的最近になって遺伝物質の大陸間交換が行われたことを示唆しています。この交換は、鳥類を媒体として、熱帯地域で進行中のワイルド ライスの動きの一部と見なすことができます。
オーストラリア北部の栽培イネの近縁種は、少なくとも 2 つの異なる分類群を含む非常に多様であることが示されており、世界のイネ生産のための未踏のより広い遺伝資源を表しています。これらは、急速な気候変動と変化する消費者の要求と好みに米を適応させる上で重要になる可能性があります.
