無機化合物：
* 水（h₂o）： 生物で最も豊富な分子はタンパク質ではありません。
* 塩（NaCl）： 多くの生物学的プロセスには重要なイオン化合物ですが、タンパク質ではありません。
* 鉱物（例：カルシウム、鉄）： タンパク質ではなく、さまざまな生物学的機能に不可欠な要素。
タンパク質ではない有機化合物：
* 炭水化物（例：砂糖、澱粉）： エネルギーと構造のサポートを提供します。
* 脂質（脂肪、油など）： エネルギーを保存し、細胞膜を形成し、ホルモンとして機能します。
* 核酸（例：DNA、RNA）： 遺伝情報を持ち、タンパク質合成に役割を果たします。
* ビタミン（例：ビタミンC、ビタミンD）： さまざまな代謝プロセスに不可欠な有機化合物。
他の非タンパク質：
* セルロース： 植物細胞壁に見られる構造多糖。
* キチン： 昆虫と真菌の外骨格に見られる構造多糖。
* ホルモン： 化学メッセンジャー、一部はタンパク質ですが、多くはそうではありません（たとえば、ステロイドホルモン）。
* 酵素： 生物学的触媒、多くはタンパク質ですが、リボザイムと呼ばれるRNA分子です。
重要な概念： タンパク質は、特定の配列で結合したアミノ酸で構成される複雑な分子です。この定義を満たさない分子はタンパク質ではありません。
