非自律的な転位要素:ゲノムのヒッチハイカー
非自動転移性要素(TE)は、ゲノム内で動き回ることができる魅力的なDNAの断片ですが、単独ではできません。彼らは自律の存在に依存しています 転置に必要な遺伝子を運ぶTES。
これが故障です:
彼らが何であるか:
* ゲノム内で移動できるが転位の遺伝子がないDNA配列。 これは、それらがモビリティのために自律的なTEの存在に依存することを意味します。
* 彼らはしばしばトランスポサゼ遺伝子または調節要素の残骸を含んでいます。 これらの残骸はしばしば非アクティブまたは不完全ですが、転置に必要なトランスポサゼ酵素の情報を依然として運びます。
なぜそれらが「非自動」と呼ばれているのか:
* 他の要素からの助けが必要です。 彼らは、自律的なTESによって生成されたトランスポサゼに依存して移動します。
* それらは本質的に寄生虫です。 彼らは、自律的なTEの機械を活用して、ゲノム内に広がる。
非自律TEのタイプ:
* 切り捨てられた要素: これらはトランスポサゼ遺伝子の一部を失い、酵素を産生することができません。
* 非コード要素: これらは機能的なトランスポサゼ遺伝子を欠いていますが、自律性TEで使用できる調節配列が含まれている場合があります。
* 「Solo LTR」要素: これらは、内部遺伝子を失っているが、長期末端繰り返し(LTR)を保持しているレトロトランスポゾンの残骸であり、他の要素では転置のために認識および使用できます。
それらがどのように動くか:
1。自律的なTe。からのトランスポサゼに依存しています このトランスポサゼは、非自律TE内の特定の配列(多くの場合、トランスポサゼ遺伝子または調節要素の残骸)を認識します。
2。トランスポサゼは、元の場所から非自律的なTEを除去します。
3。切除された要素は、ゲノム内の新しい場所に挿入されます。
ゲノムへの影響:
* 彼らはゲノムの進化と可塑性に寄与する可能性があります。 それらは遺伝子を破壊し、突然変異を引き起こす可能性がありますが、新しい配列を導入し、遺伝的多様性につながることもあります。
* 彼らは遺伝子調節に役割を果たすことができます。 非自動TEは、ゲノムの調節要素と相互作用し、遺伝子発現に影響を与えます。
* 組換えのホットスポットとして機能できます。 それらの繰り返しのシーケンスは、組換えイベントを促進し、ゲノムの再編成につながる可能性があります。
例:
*トウモロコシのAC/DSシステム: AC(自律)要素は、DS(非自律)要素が移動するために必要なトランスポサゼを生成します。
* ショウジョウバエのP要素: P要素は、トランスポサゼ遺伝子の存在に応じて、自律的または非自律的なものである可能性があります。
全体:
非自動TEは、他の元素の機械を悪用してゲノム内に広がる魅力的な遺伝的寄生虫の魅力的な例です。それらはゲノムの進化と可塑性に寄与しますが、破壊や突然変異を引き起こす可能性もあります。それらのメカニズムと影響を理解することは、ゲノムダイナミクスの複雑さを解読するために重要です。