1。形態的比較：
* 解剖学： 骨、筋肉、臓器、外部の特徴など、生物の構造を比較します。これは、進化的関係を明らかにし、祖先を共有することができます。
* 生理学： 代謝、呼吸、循環を含む身体の機能を調べます。同様の生理学的適応は、しばしば密接な関係を示しています。
* 発生学： 胚の発達を研究することは、成人では明らかではない可能性のある初期段階で類似性を明らかにする可能性があります。
* 化石記録： 進化的な系統を理解し、時間の経過とともに変化を追跡するために、古代の生物の保存された遺跡を調べます。
2。分子比較：
* DNAシーケンス： DNA配列におけるヌクレオチド（A、T、C、G）の順序の決定。 密接に関連する種には、より類似したDNA配列があります。
* タンパク質シーケンス： タンパク質中のアミノ酸の順序を決定します。同様のタンパク質配列は、進化的関係を示しています。
* ゲノム分析： ゲノム全体を比較して、共有遺伝子、遺伝子秩序、およびその他のゲノム機能を特定します。
3。生態学的比較：
* 生息地とニッチ： 生物がどこに住んでいるのか、どのリソースを使用するかを分析します。同様の生態学的ニッチは、多くの場合、同様の環境への進化的適応を示唆しています。
* 相互作用： 生物がどのように互いに相互作用し、捕食者と婚約の関係、競争、共生を含む環境と相互作用するかを調べます。
* 分布： 生物の地理的範囲をマッピングし、分散と分離のパターンを分析します。
4。行動比較：
* 理学： コミュニケーション、交尾の儀式、採餌戦略、社会的相互作用など、生物の行動を研究する。
* 認知能力： 問題解決、学習、記憶などの生物の精神的能力の評価。
5。系統解析：
* cladistics： 共有された派生特性（Synapomorphies）を使用して、生物間の関係を示す進化の木（クラドグラム）を構築します。
* 分子時計： DNAまたはタンパク質の突然変異率を使用して、系統間の発散の時間を推定します。
これらの方法は、生物間の関係と違いを包括的に理解するために組み合わせてよく使用されます。
