細胞溶解：アニオン性洗剤であるSDSは、リン脂質の疎水性尾部と相互作用することにより、細胞膜のリン脂質二重層を破壊します。この相互作用は膜の崩壊につながり、細胞が開いて内容物を開いて放出します。
細胞成分の溶解：細胞溶解後、SDSは、タンパク質や脂質を含むさまざまな細胞成分の溶解度を溶解して維持し、それらを変性させ、凝集を防ぐことにより、維持するのに役立ちます。これにより、DNAはアクセス可能なままであり、分離プロセスの後続のステップを促進します。
タンパク質の変性：SDSには、DNA分離に不可欠なタンパク質を変性させる能力があります。タンパク質はDNAにしっかりと結合し、その抽出を妨げる可能性があります。タンパク質を変性させることにより、SDSはこれらのタンパク質DNA相互作用を破壊し、他の細胞成分からDNAを効率的に分離できるようにします。
DNAアクセシビリティ：タンパク質の変性はDNA分子も露出し、DNA分離プロトコルの後続のステップで使用される酵素や試薬によりアクセスしやすくします。
SDSタンパク質複合体：SDSはミセルを形成します。ミセルは、疎水性の内部と親水性の外側を備えた球形構造です。変性タンパク質は、SDSミセルの疎水性領域に結合し、それらを溶液に保ち、DNA精製との干渉を防ぐ複合体を形成します。
核酸沈殿：CTAB（セチルトリメチル臭化アンモニウム）法などのいくつかのDNA分離法では、SDSを使用して核酸の沈殿を強化できます。それはCTABと複合体を形成し、それが負に帯電したDNA骨格に結合し、遠心分離によって簡単にペレットされる可能性のある密な核酸セテルゲント沈殿物の形成を促進します。
SDSは、制限酵素などの一部の酵素の活性を阻害できるため、DNA分離手順中にDNA分離手順中にDNAへの曝露の濃度とDNAへの曝露期間を慎重に制御する必要があることに注意することが重要です。
