その理由は次のとおりです。
* ノーザンブロッティングは、ポリアクリルアミドゲルではなく、アガロースゲルを使用します。 ポリアクリルアミドゲルは、SDS-PAGE(ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動)で使用され、タンパク質をサイズごとに分離します。ホルムアルデヒドは、タンパク質構造の完全性を維持するために、一部のSDS-PAGEプロトコルで使用されています。
* ノーザンブロッティングターゲットRNA、タンパク質ではありません。 RNAは、ポリアクリルアミドゲルではなく、アガロースゲルを使用してサイズによって分離されます。このコンテキストでRNA構造を維持するためにホルムアルデヒドは必要ありません。
ここでノーザンブロッティングジェル準備で使用されるもの:
* アガロース: Gelマトリックスを形成する多糖類で、RNA分子をサイズで分離します。
* バッファ: 通常、Tris-Borate-EDTA(TBE)またはTris-Acetate-EDTA(TAE)バッファーを搭載し、電気泳動用の導電性培地を提供します。
* ホルムアルデヒド(オプション): ホルムアルデヒドは、ノーザンブロッティング中に電気泳動緩衝液に *時々 *追加されますが、これはゲル自体を準備することではありません。 RNA分子を変性させるために使用され、構造ではなくサイズのみに基づいてゲルを介して移動するようにします。
要約: ホルムアルデヒドは、ノーザンブロッティングジェル準備において役割を果たしていません。一部のプロトコルでは、電気泳動中にRNA分子を変性させるために使用されますが、ゲル自体では使用されません。