主な違い – VNTR と STR
反復 DNA は、ゲノム全体で複数のコピーが発生する核酸のパターンです。それらは、真核生物の核 DNA の大部分を占めています。タンデムリピートは、互いに隣接する反復配列単位をコピーしてヌクレオチドブロックを形成する反復 DNA の主要なタイプの 1 つです。 VNTR (可変数タンデム リピート) と STR (短いタンデム リピート) は、真核生物のゲノムに見られる 2 種類のタンデム リピートです。 VNTR はミニサテライト DNA の一種ですが、STR はマイクロサテライト DNA の一種です。 主な違い VNTR と STR の違いは、VNTR の反復単位が 10 ～ 60 塩基対であるのに対し、STR の反復単位は 2 ～ 6 塩基対であることです。 .
対象となる主な分野
1. VNTRとは
– 定義、機能、重要性
2. STRとは
– 定義、特徴、重要性
3. VNTR と STR の類似点は何ですか
– 共通機能の概要
4. VNTR と STR の違いは何ですか
– 主な相違点の比較
重要な用語:法医学遺伝学、マイクロサテライト、ミニサテライト、反復ヌクレオチド単位、STR、タンデム反復、VNTR
VNTR とは
VNTR は、ヌクレオチドの短い配列 (10 ～ 60 塩基対) が特定の遺伝子座でさまざまな回数繰り返されるタンデム反復の一種を指します。そのため、VNTR は小型衛星とも呼ばれます。 . VNTR は、真核生物ゲノムの染色体全体に点在しています。一般に、VNTR で繰り返される単位の数は個人によって異なります。したがって、VNTR によって形成される配列の長さも個人によって異なります。染色体の異体番号は両親から受け継がれるため、親や個人の識別に利用できます。 6 人の VNTR の変動を 図 1 に示します。 .
図 1:個人の VNTR 変動
VNTR は、特定の人物の DNA 特性を決定するために DNA プロファイリングで使用される最初の種類の多型です。それらは、PCR、ゲル電気泳動、およびサザンブロッティングによるバンドパターンの生成を使用する技術である RFLP（制限断片長多型）の遺伝子マーカーとしても使用されます。
STRとは
STR は、特定の遺伝子座でヌクレオチドの短い配列 (2 ～ 6 塩基対) がさまざまな回数繰り返されるタンデム反復の一種を指します。 STRはマイクロサテライトの一種で、植物遺伝学では短配列反復（SSR）としても知られています。単一のヌクレオチドで構成される繰り返し単位は、一塩基多型 (SNP) として知られています。 STR は、法医学遺伝学で現在分析されている最も一般的なタイプの遺伝子多型です。 STR を遺伝子マーカーとして使用した DNA プロファイリングを 図 2 に示します。
図 2:DNA プロファイリング
一部の STR 領域の変異は、脆弱 X 症候群やハンチントン病などの遺伝病を引き起こします。
VNTR と STR の類似点
- VNTR と STR は 2 種類のタンデム リピートです。
- VNTR と STR はどちらも真核生物ゲノムの構造領域です。
- VNTR と STR はどちらも非コード DNA で構成されています。
- VNTR と STR はどちらも親から継承されます。
- VNTR と STR はどちらも反復シーケンスで構成され、配列内で互いに隣接して配置されます。
- VNTR と STR の両方が遺伝子多型を生成します。
- VNTR と STR の両方がゲノム全体に広がっています。
- VNTR と STR の両方が法医学遺伝学の遺伝子マーカーとして使用されます。
- VNTR と STR の両方の突然変異は遺伝病につながります。
VNTR と STR の違い
定義
VNTR: VNTR はタンデム反復の一種であり、特定の遺伝子座でヌクレオチドの短い配列 (10 ～ 60 塩基対) がさまざまな回数繰り返されます。
STR: STR はタンデムリピートの一種で、特定の遺伝子座でヌクレオチドの短い配列 (2 ～ 6 塩基対) がさまざまな回数繰り返されます。
反復ヌクレオチドの数
VNTR: VNTR は 10 ～ 60 塩基対で構成されています。
STR: STR は 2 ～ 6 塩基対で構成されています。
反復DNAのタイプ
VNTR: VNTR はミニサテライト DNA の一種です。
STR: STR はマイクロサテライト DNA の一種です。
繰り返し回数
VNTR: VNTR は、配列内の 10 ～ 1,500 の繰り返しで構成されます。
STR: STR は、配列内の 5 ～ 200 の繰り返しで構成されます。
配列のサイズ
VNTR: VNTR は 0.5 ～ 15 kb の配列を形成します。
STR: STR は 10 ～ 1000 bp の配列を形成します。
配列の複雑さ
VNTR: VNTR は異種配列を生成します。
STR: STR は同種の配列を生成します。
結論
VNTR と STR は、真核生物ゲノムで隣接する反復単位の配列を形成する 2 種類のタンデム反復です。 VNTR は、ヌクレオチドの比較的長い繰り返し単位 (10 ～ 60 塩基対) で構成されます。 STR は、ヌクレオチドの短い繰り返し単位 (2 ～ 6 bp) で構成されます。 VNTR と STR の主な違いは、各タイプのタンデム反復の反復単位の長さです。
参照:
1.「可変数タンデムリピート」 ScienceDirect のトピックは、こちらから入手できます。
2.「法医学遺伝学の科学」。 CRG – 責任ある遺伝学評議会、こちらから入手可能。
画像提供:
1. 英語版ウィキペディアの PaleWhaleGail による「D1S80Demo」(CC BY-SA 3.0)、コモンズ ウィキメディア経由
2. Sneptunebear16 による「遺伝子フィンガープリンティングの段階」 – 自身の作品 (CC BY-SA 4.0)、コモンズ ウィキメディア経由
