主な違い - 反復 DNA とサテライト DNA
反復 DNA とサテライト DNA は、ほとんどの真核生物のゲノムに見られる 2 種類の DNA です。 主な違い 反復 DNA とサテライト DNA の違いは、 反復 DNA は数百回または数千回繰り返される DNA の小さな配列であるのに対し、サテライト DNA は非常に反復的な DNA 配列であり、ゲノムのかなりの部分を構成する .ゲノムに見られるリピートには、タンデムリピートと散在リピートの 2 種類があります。サテライト DNA は、短い基本反復単位の多数のタンデム反復で構成されます。ヒトゲノムの特定の染色体上にあり、染色体のセントロメアの近くにあります。
対象となる主な分野
1.反復 DNA とは
– 定義、脂肪、種類
2.サテライト DNA とは
– 定義、事実、種類
3.反復 DNA とサテライト DNA の類似点は何ですか
– 共通機能の概要
4.反復 DNA とサテライト DNA の違いは何ですか
– 主な相違点の比較
重要な用語:散在反復、マイクロサテライト、ミニサテライト、反復 DNA、サテライト DNA、タンデム反復
反復 DNA とは
反復 DNA とは、ゲノム全体で繰り返される DNA のストレッチを指します。これは、ユークロマチン全体に広がる非コード DNA の量を表します。反復単位は、数塩基対から数百塩基対で構成され得る。反復単位の平均サイズは 300 bp です。ゲノムごとに 10 ～ 10 コピーを繰り返すことができます。反復DNAの2つの主なタイプは、タンデム反復と散在反復です。タンデムリピートは 図 1 に示されています .
図 1:タンデム リピート
タンデム反復では、反復配列単位のコピーが互いに隣接して配置され、ブロックまたは配列を形成します。サテライト DNA はタンデムリピートの一種です。散在反復では、反復配列は、固有の配列が隣接する単一ユニットとしてゲノム全体に分散しています。 DNA トランスポゾンやレトロトランスポゾンなどの転移因子は、点在する反復です。
サテライト DNA とは
サテライト DNA とは、ゲノムのセントロメア領域によく見られる、短くて反復的な DNA 配列を指します。セントロメアの主要な機能単位です。サテライト DNA は、主要な構造構成要素としてヘテロクロマチンにも見られます。ヒトゲノムでは、サテライト DNA は染色体 1、9、および 16 と、染色体 13 ～ 15、21、および 22 の短腕に見られます。サテライト DNA はタンデムリピートの一種です。これは、ゲノム内で 10 回以上繰り返される 60 bp 前後の短いヌクレオチド配列で構成されています。サテライト DNA の主な 2 種類は、ミニサテライトとマイクロサテライトです。ミニサテライト シーケンスを 図 2 に示します .
図 2:ミニサテライト DNA
ミニサテライトは、繰り返し単位の 10 ～ 60 塩基対で構成されています。それらはセントロメアを含むゲノムの多くの場所に位置しています。マイクロサテライトは、繰り返し単位が 10 未満の塩基対で構成され、主にテロメアに見られます。
反復 DNA とサテライト DNA の類似点
- 反復 DNA とサテライト DNA は、真核生物のゲノムに見られる 2 種類の DNA です。
- 反復 DNA とサテライト DNA はどちらも反復配列単位で構成されています。
- 反復 DNA とサテライト DNA はどちらも非コード DNA の一種です。
- 反復 DNA とサテライト DNA はどちらもタンパク質をコードしません。
- 反復 DNA とサテライト DNA はどちらも遺伝子間領域にあります。
- 反復 DNA とサテライト DNA の両方が、ゲノムの構造を維持する上で重要です。
反復 DNA とサテライト DNA の違い
定義
反復 DNA: 反復 DNA は、ゲノム全体で繰り返される DNA のストレッチを指します。
サテライト DNA: サテライト DNA は、ゲノムのセントロメア領域でよく見られる短い反復 DNA 配列を指します。
反復シーケンスのタイプ
反復 DNA: 反復 DNA は、タンデム反復または点在反復のいずれかで構成されます。
サテライト DNA: サテライト DNA はタンデムリピートで構成されています。
反復単位のサイズ
反復 DNA: 反復 DNA は、反復単位で数塩基対から数百塩基対で構成される場合があります。
サテライト DNA: サテライト DNA は、短い反復単位 (最大 60 塩基対の長さ) で構成されています。
繰り返しの程度
反復 DNA: 反復 DNA は、適度に反復する配列です (ゲノムあたり 10 ～ 10 回の反復)。
サテライト DNA: サテライト DNA は、非常に反復性の高い配列で構成されています (ゲノムあたり 10 回以上の反復)。
所在地
反復 DNA: 反復 DNA は、ゲノムの遺伝子間領域にあります。
サテライト DNA: サテライト DNA は、特定の染色体および染色体の動原体に位置しています。
タイプ
反復 DNA: 反復 DNA の 2 つの主なタイプは、縦列反復と点在反復です。
サテライト DNA: サテライト DNA の主な 2 種類は、マイクロサテライトとミニサテライトです。
役割
反復 DNA: 反復 DNA は進化の装置として機能し、新しい遺伝子の形成を触媒します。
サテライト DNA: サテライト DNA は、DNA フィンガープリンティングにおいて主要な役割を果たします。
CsCl 密度勾配分析
反復 DNA: 反復 DNA は薄いバンドとして表示されます。
サテライト DNA: サテライト DNA は小さな暗いバンドとして表示されます。
結論
反復 DNA とサテライト DNA は、ゲノムに見られる 2 種類の DNA 反復です。反復 DNA は適度に繰り返される DNA 配列ですが、サテライト DNA は非常に繰り返される短い DNA 配列です。反復 DNA とサテライト DNA の主な違いは、反復の程度です。
参照:
1.López-Flores、I.、およびM.A. Garrido-Ramos。 「真核生物ゲノムの反復 DNA コンテンツ」。 Karger Publishers、2012 年 6 月 25 日、こちらから入手可能。
2.Garrido-Ramos、Manuel A.「衛星 DNA:進化するトピック」。遺伝子、MDPI、2017 年 9 月、こちらから入手可能。
画像提供:
1. 「VNTR2individuals5or7repeats」マデリンドットソン著 – Commons Wikimedia による自身の作品 (CC BY-SA 4.0)
