ctDNA と cfDNA の主な違い ctDNA は血流中を循環している腫瘍 DNA または腫瘍由来の断片化された DNA であり、細胞とは関係がないのに対し、cfDNA は血流中を自由に循環し、腫瘍の起源を持たない無細胞 DNA です。
ctDNA と cfDNA は、細胞を持たずに血流中を自由に循環する 2 種類の DNA です。通常、単一の細胞は遊離 DNA の大部分を血流に放出することができます。
主な用語
cfDNA、ctDNA
ctDNA とは
ctDNA は循環している腫瘍 DNA または腫瘍細胞由来の DNA 断片です。 ctDNA の主な特徴は、ctDNA が腫瘍ゲノム全体を反映していることです。また、この DNA は、治療プロセス全体で腫瘍の進行を監視する上で重要です。 ctDNA から腫瘍 DNA をモニタリングする技術は、リキッドバイオプシーです。 ctDNA が誰かの血流に存在する場合、それは腫瘍の存在を反映しています。科学者は、血流から ctDNA を捕捉し、次世代シーケンシングでモニタリングすることにより、腫瘍細胞の変異を検出できます。
図 1:ctDNA
さらに、ctDNA は腫瘍または循環腫瘍細胞に直接由来します。一般に、循環腫瘍細胞とは、原発腫瘍から脱落し、血流またはリンパ系に入る生存可能な無傷の腫瘍細胞を指します。これらの細胞はアポトーシスまたは壊死を経て、その DNA を血流に放出します。血流中に ctDNA を発生させるもう 1 つの方法は、腫瘍細胞からの積極的な放出です。
cfDNA とは
cfDNA は遊離 DNA を循環しており、血漿中のサイズが 50 ~ 200 bp の DNA 断片です。血流にはいくつかの形態の cfDNA があります。これらには一般に、循環腫瘍 DNA (ctDNA)、循環セルフリー ミトコンドリア DNA (ccf mtDNA)、およびセルフリー胎児 DNA (cffDNA) が含まれます。ここでは、循環する DNA は二本鎖で細胞外です。一方、無細胞ミトコンドリア DNA は、ストレス、損傷、または病理学的事象の際に細胞によって放出されるミトコンドリア DNA の短いセクションを指します。一方、無細胞胎児DNAとは、母体の血液中を循環する胎児DNAを指します。しかし、cffDNA は分娩後 2 時間の母体血では検出されません。
図 2:cfDNA の起源
さらに、cfDNA レベルの上昇は癌で検出可能です。これにより、ctDNA のレベルが上昇します。がん以外にも、cfDNA は外傷、敗血症、無菌性炎症、心筋梗塞、脳卒中、移植、糖尿病、鎌状赤血球症において重要です。
ctDNA と cfDNA の類似点
- ctDNA と cfDNA は、細胞なしで血流中を自由に循環する 2 種類の DNA です。
- 遊離 DNA の起源は、血流中の対応する細胞のアポトーシスと壊死です。
- 遊離 DNA の断片サイズは 166 bp で、これはヌクレオソームとリンカーに巻き付けられた DNA の長さに相当します。これは、遊離 DNA の形成がアポトーシス DNA 断片化の起源であることを反映しています。
- 単一の細胞は、遊離 DNA の大部分を血流に放出できます。
ctDNA と cfDNA の違い
定義
ctDNA は、腫瘍細胞に由来し、他のソースからの無細胞 DNA と一緒に血液中を循環する DNA の断片を指し、cfDNA は、血流中のカプセル化されていないすべての DNA を指します。 .
原点
通常、ctDNA は腫瘍または循環腫瘍細胞から直接発生しますが、cfDNA はアポトーシスまたは壊死後に血流に入ります。
キャリー
ctDNA は腫瘍細胞ゲノムからの情報を運び、cfDNA はゲノム全体の DNA 情報を運びます。
入力
ctDNA は cfDNA の一種ですが、他のタイプの cfDNA には無細胞ミトコンドリア DNA (cf mtDNA) と無細胞胎児 DNA (cffDNA) が含まれます。
結論
簡単に言うと、ctDNA と cfDNA は、血流中を自由に循環する 2 種類の DNA です。ただし、ctDNA は、がんの存在下で上昇する循環腫瘍 DNA です。 ctDNA とは別に、他のタイプの cfDNA があります。これらはccfDNAとcffDNAです。したがって、ctDNA は遊離 DNA を循環させる cfDNA の一種です。通常、cfDNA は、細胞のアポトーシスと壊死の結果として血流中に発生します。ただし、ctDNA は腫瘍細胞のアポトーシスに由来します。したがって、ctDNA と cfDNA の主な違いはその起源です。