広範な二次構造や修飾されたヌクレオチドを含むような複雑な構造を持つmRNAは、リボソームが解読して翻訳するためにより多くの時間と労力を必要とします。このデコードの複雑さの増加は、タンパク質合成の遅延と、翻訳中のエラーや失速の可能性が高くなる可能性があります。
その結果、より複雑な構造を持つmRNAはしばしば効率が低く、より単純な構造を持つmRNAと比較して寿命が短くなります。細胞機構は、これらの複雑なmRNAをより迅速に認識して分解し、非機能または誤ったタンパク質の蓄積を防ぎます。
さらに、複雑な構造を持つmRNAは、RNA分子を分解する酵素である細胞ヌクレアーゼによる分解の影響を受けやすくなります。これらのmRNAに存在する複雑な二次構造と修正は、ヌクレアーゼが結合して劣化を開始するためのアクセス可能な部位を提供できます。
さらに、翻訳されていない領域（UTRS）やMicroRNA結合部位など、mRNA内の調節要素の存在もmRNAの安定性に影響を与える可能性があります。これらの元素は、RNA結合タンパク質、miRNA、およびその他の調節因子とのmRNA相互作用を調節することができ、それによりmRNAの離職率に影響を与えます。
したがって、解読がより困難な青写真を持つmRNAは、デコードの複雑さ、分解に対する感受性、および調節要素の影響により、寿命が短くなり、効率的な遺伝子発現と細胞機能が確保されます。
