1。ウイルスゲノムシーケンス:
- 科学者は、患者から収集されたCOVID-19サンプルのウイルスゲノム全体を配列します。
- 次世代シーケンス(NGS)などのハイスループットシーケンス技術を使用して、ウイルスの遺伝的配列を決定します。
- これは、ウイルスゲノムの包括的な理解を提供し、発生した可能性のある特定の変異、挿入、または削除を特定します。
2。系統解析:
- 系統解析には、ウイルスゲノム配列に基づいて進化樹を構築することが含まれます。
- 異なるCOVID-19サンプルの遺伝的配列を比較することにより、科学者はウイルスの関連性と進化的歴史を決定できます。
- これは、ウイルスの地理的起源と伝送経路を追跡するのに役立ちます。
3。バリアント識別:
- Covid-19ウイルスが進化するにつれて、新しい遺伝的変異体が出現します。
- 科学者は、ウイルスゲノム配列を元のSARS-COV-2の参照配列と比較することにより、これらのバリアントを継続的に監視します。
- ウイルスの行動、伝染性、または免疫応答に大きな変化または潜在的な影響を与えるバリアントは、さらなる調査のために「懸念のバリアント」(VOCS)または「関心のあるバリアント」(VOIS)として指定されます。
4。突然変異追跡:
- ゲノム監視を通じて、研究者は時間の経過とともにウイルスゲノムの特定の変異を追跡します。
- スパイクタンパク質などのウイルスゲノムの特定の領域の変異は、宿主細胞に結合し、免疫応答を回避するウイルスの能力に影響を与える可能性があります。
- モニタリング変異は、ワクチンの有効性、診断テスト、および治療戦略に対する潜在的な影響を理解するのに役立ちます。
5。ゲノム疫学:
- ゲノム疫学は、ウイルスゲノムシーケンスと疫学データを組み合わせています。
- さまざまな地理的地域におけるCOVID-19株の遺伝的多様性と分布を分析することにより、科学者はウイルスの伝播と拡散に影響を与える要因を特定できます。
- この情報は、公衆衛生の介入と封じ込め戦略をサポートしています。
6。リアルタイム監視:
- 一部の研究グループおよび公衆衛生機関は、Covid-19の遺伝的進化のリアルタイム監視を提供する監視システムを確立しています。
- これらのシステムは、ウイルスゲノムシーケンスを継続的に収集および分析して、新たなバリアントを追跡し、公衆衛生政策と意思決定を通知します。
これらの遺伝的追跡方法を採用することにより、科学者はCovid-19の進化を監視し、新しいバリアントに関連する潜在的なリスクを特定し、パンデミックと効果的に戦うための継続的な努力に貢献することを目指しています。