* リボソームRNA（RRNA）遺伝子： これらの遺伝子はタンパク質合成に不可欠であり、異なる生物で高度に保存されています。 RRNAシーケンスを比較すると、深い進化的関係が明らかになります。
* 他の高度に保存された遺伝子： DNAの複製や転写などの必須細胞プロセスに関与する遺伝子も、比較の良い候補です。
他の分子比較はしませんか？
* タンパク質： タンパク質配列は関係に関する情報を提供できますが、DNA配列よりも急速に進化し、深い進化的つながりを示す可能性が高くなります。
* 炭水化物： 菌類、植物、および動物は異なる細胞壁構造と炭水化物の組成を持っていますが、これらの違いは、DNA配列ほど深い進化関係を決定するための有益ではありません。
* 脂質： 脂質は非常に多様であり、遠い進化的関係を比較するのに特に役立ちません。
何を期待するか：
重要な遺伝子のDNA配列を比較すると、菌類は植物よりも動物とより密接に関連していることがわかります 。これは驚くべきことに思えるかもしれませんが、分子生物学、細胞構造、生化学を含むさまざまな分野からの大きな証拠によってサポートされています。
注： DNA配列を比較することは最も信頼できる方法ですが、タンパク質構造や代謝経路などの他の分子比較は補足情報を提供できます。
