1。形態学的データ： この従来の方法は、骨構造、臓器の配置、外部の特徴など、生物の物理的特性を調べます。異なる種でこれらの特徴を比較することにより、科学者は進化的関係を示唆する類似点と相違点を特定できます。たとえば、哺乳類、爬虫類、鳥にバックボーンの存在は、共有された祖先を示唆しています。
2。分子データ： この方法では、DNAまたはタンパク質配列を使用して進化的関係を再構築します。遺伝的配列を比較することにより、科学者は、関連する種がどれほど密接に関連しているかを示す類似点と相違点を特定できます。この方法は、遠く関連する生物を分析するために使用できるため、特に強力です。たとえば、人間とチンパンジーのDNA配列を比較すると、密接な進化的関係が明らかになります。
3。化石記録： この方法では、古代生物の保存された遺跡を使用して、生命の進化の歴史を理解しています。化石を研究することにより、科学者は地球上の生命のタイムラインを再構築し、共通の祖先を特定することができます。たとえば、 *Archeopteryx *のような移行性化石の発見は、恐竜からの鳥の進化の証拠を提供します。
各方法には長所と短所があります。形態学的データは収集するのは比較的簡単ですが、収束進化（関連性のない生物が同様の特性を進化させる）の影響を受ける可能性があります。分子データは非常に正確ですが、高度な技術が必要であり、水平遺伝子移動の影響を受ける可能性があります。化石データは生活の歴史を理解するために不可欠ですが、化石の入手可能性によって制限されています。
これらの方法を組み合わせることにより、科学者は種間の進化的関係を正確に表す包括的な系統樹を構築できます。
