光顕微鏡：
* 明るいフィールド顕微鏡： これは最も一般的なタイプです。目に見える光を使用してサンプルを照らし、一連のレンズを介して画像を形成します。基本的な細胞構造と染色技術を観察するのに適していますが、解像度は限られています。
* ダークフィールド顕微鏡： このタイプは、特別なコンデンサーを使用して、側面からサンプルを照らします。これにより、暗い背景が作成され、染色されていない透明なオブジェクトが表示されます。生きている細胞とその動きを観察するのに役立ちます。
* 相コントラスト顕微鏡： この手法は、セルの異なる部分間の屈折指数の違いを活用します。コントラストが強化された画像を作成し、生細胞とその内部構造の観察を可能にします。
* 微分干渉コントラスト（DIC）顕微鏡： 位相制御顕微鏡と同様に、DICは3次元効果を作成し、セルをシャドウがあるかのように見せます。これは、生細胞の構造を観察するのに特に役立ちます。
* 蛍光顕微鏡： この手法は、特定の細胞構造に結合する蛍光色素またはタンパク質を利用します。特定の波長の光で照らされると、これらの構造は蛍光を放出し、分布と動きの視覚化を可能にします。
電子顕微鏡：
* 透過電子顕微鏡（TEM）： このタイプは、電子のビームを使用して、薄いサンプルを照らします。高分解能と倍率を提供し、オルガネラ、タンパク質、さらには分子などの超微細な詳細の観察を可能にします。サンプルの複雑な準備が必要です。
* 走査型電子顕微鏡（SEM）： この手法では、電子の集中ビームを使用して、サンプルの表面をスキャンします。表面の3D画像を生成し、細胞の地形と表面構造を明らかにします。
他のタイプ：
* 共焦点顕微鏡： この手法は、レーザービームを使用してサンプル内の特定の平面を照らし、背景蛍光を減らし、3次元構造の鋭い画像を作成します。
* 原子間顕微鏡（AFM）： この手法は、鋭いチップを使用してサンプルの表面をスキャンし、細胞表面の非常に高解像度の画像を提供します。細胞の地形と機械的特性を研究するのに特に役立ちます。
顕微鏡の選択は、特定の研究の質問と求められる情報の種類に依存します。光顕微鏡は、生細胞とその基本構造の研究に最適ですが、電子顕微鏡は細かい詳細と超微細構造を観察するために使用されます。共焦点およびAFM顕微鏡は、より高い解像度と3次元イメージング機能を提供します。
