1。標的タンパク質のmRNAを分離します:
* RNA抽出: 科学者は、カエルから肝臓組織を取得し、全RNAを抽出する必要があります。これには、細胞を破壊し、特殊な試薬を使用して他の細胞成分からRNAを分離することが含まれます。
2。 cDNAライブラリを作成:
* 逆転写: 孤立したmRNAを使用して、科学者は逆転写を行います。これは、逆転写酵素と呼ばれる酵素がmRNAを相補的なDNA(cDNA)に変換するプロセスです。このcDNAは、クローニングのテンプレートとして機能します。
* cDNAライブラリ構造: 次に、cDNAをベクター(通常はプラスミド)に挿入し、細菌内で複製できます。異なるcDNAフラグメントを含むベクターのこのコレクションは、cDNAライブラリと呼ばれます。
3。ターゲットcDNAのライブラリをスクリーニングします:
* プローブ設計: 科学者は、望ましいカエルタンパク質をコードするcDNAを識別するプローブを必要としています。このプローブは次のとおりです。
* オリゴヌクレオチドプローブ: 標的タンパク質の既知の配列に基づいて設計された短い合成DNA配列(利用可能な場合)。
* 抗体プローブ: 標的タンパク質に特異的な抗体を使用して、ライブラリ内の対応するcDNAを検出できます。
* スクリーニング: cDNAライブラリはプローブでスクリーニングされています。これは、次のような手法を使用して実行できます。
* コロニーハイブリダイゼーション: cDNAライブラリーを含む細菌は、寒天上にメッキされています。プローブにはラベルが付けられ、コロニーに結合することができます。ターゲットcDNAを含むコロニーは、プローブでハイブリダイズし、識別できます。
* PCRスクリーニング: PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)を使用して、既知の配列から設計されたプライマーを使用してターゲットcDNAを増幅することができます。
4。ターゲットcDNAのシーケンスと検証:
* サンガーシーケンス: ターゲットcDNAが分離されたら、その同一性を確認し、正しいタンパク質をコードすることを確認するためにシーケンスする必要があります。
* バイオインフォマティクス分析: cDNAシーケンスをデータベースと比較して、相同配列を見つけ、その同一性を確認できます。
5。式ベクトルの設計と構築:
* 発現ベクター: 科学者は、適切な宿主生物(たとえば、細菌、酵母、または哺乳類細胞)で標的タンパク質を発現するために使用できるベクターを必要とします。この式ベクターには以下が含まれます。
* プロモーター: 標的遺伝子の発現を駆動するDNA配列。
* ターゲット遺伝子(cDNA): カエルタンパク質をコードする分離されたcDNA。
* リボソーム結合部位(RBS): リボソームがタンパク質合成を開始するのに役立つ配列。
* 選択マーカー: 発現ベクターを取り上げた細胞の選択を可能にする遺伝子。
6。発現ベクターを宿主生物に変換します:
* 変換: 標的cDNAを含む発現ベクターは、宿主生物(たとえば細菌細胞)に導入されます。
* 選択: 変換されたセルは、式ベクトルの選択マーカーを使用して選択されます。
7。標的タンパク質を発現および精製します:
* タンパク質発現: 宿主細胞は、標的タンパク質の発現を促進する条件下で成長します。
* タンパク質精製: タンパク質は細胞から抽出され、クロマトグラフィーのような技術を使用して他の細胞成分から分離します。
8。特性評価と分析:
* 検証: 精製されたタンパク質を分析して、その同一性、折りたたみ、および活性を確認します。
* 機能研究: タンパク質は、その機能、他の分子との相互作用、または潜在的な治療用途など、さらなる研究に使用できます。
重要な考慮事項:
* タンパク質の折りたたみ: 宿主生物でタンパク質が正しく折りたたまれるようにすることが重要です。
* 翻訳後修飾: 一部のタンパク質は、翻訳後に修飾(グリコシル化など)が必要です。宿主生物は、これらの修飾を実行できない場合があり、タンパク質の機能に影響を与える可能性があります。
* 倫理と安全性: カエル組織や遺伝子組み換え生物を使用する場合、適切な倫理的考慮事項と安全プロトコルに従う必要があります。
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