これが故障です：
* クロマチン： 核内のDNA含有物質は、しばしばヘマトキシリンのような塩基性染料で暗く染みます。
* 核小体： リボソーム合成に関与する核内の密な領域は、しばしば暗く染色されます。
* リボソーム： タンパク質合成の部位は、RNA含有量に結合する特定の染料で染色できます。
* 小胞体（ER）： タンパク質合成と脂質代謝に関与する膜のネットワーク。リボソームが散りばめられた粗いERは、しばしば滑らかなERよりも暗く染みます。
* ゴルジ装置： 処理および包装タンパク質に関与する一連の平坦化された嚢は、その膜に結合する特定の染料で染色できます。
* ミトコンドリア： ATP生産を担当するセルの電力ハウス。 Janus Green Bのような染料で染色することができます。
* リソソーム： 細胞消化用の酵素を含むSAC様オルガネラは、酵素に結合する特定の色素で染色できます。
* 細胞質： 細胞を満たすゼリーのような物質は、含まれる細胞成分に応じてさまざまな染料で染色できます。
重要な注意： これらのオルガネラの特定の染色特性は、使用される色素の種類とオルガネラの化学組成に依存します。
例： 塩基性染料であるヘマトキシリンは、核（DNAなど）青の酸性成分を染色します。酸性染料であるエオシンは、細胞質（タンパク質のような）ピンクの基本的な成分を染色します。これが、染色された細胞に青い核とピンクの細胞質をよく見る理由です。
