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タンパク質の二次構造は何から生じますか?

タンパク質の二次構造は、水素結合に起因します アミノ酸鎖の骨格原子の間。具体的には、1つのアミノ酸のカルボニル酸素と別のアミノ酸のアミド水素の間に水素結合が形成されます。

これが故障です:

* アミノ酸バックボーン: ポリペプチド鎖は、アミノ酸の繰り返し単位で構成されています。各アミノ酸には、次のように結合した中心炭素原子(アルファ炭素)があります。

*アミノグループ(-NH2)

*カルボキシル基(-COOH)

*水素原子(-H)

*異なるアミノ酸によって変化するサイドチェーン(Rグループ)。

* 水素結合: 1つのアミノ酸のカルボニル酸素はわずかに陰性であり、別のアミノ酸のアミド水素はわずかに陽性です。これらの反対の電荷は、弱い水素結合を引き付け、形成します。

* 二次構造形成: これらの水素結合は、ポリペプチド鎖の近くのアミノ酸間で発生し、鎖が次のような特定の繰り返しパターンに折りたたまれます。

* アルファヘリックス: 4番目のアミノ酸ごとの水素結合によって安定化されたコイル状構造。

* ベータシート: ポリペプチド鎖の隣接鎖間の水素結合によって形成される平らなプリーツ構造。

水素結合は二次構造形成を駆動する主力ですが、他の要因も次のような役割を果たします。

* アミノ酸配列: ポリペプチド鎖のアミノ酸の特定の配列は、どの二次構造が可能であるかを決定します。

* 疎水性相互作用: 非極性側鎖は、全体的な折りたたみパターンに影響を与える傾向があります。

二次構造の形成を理解することは、タンパク質の全体的な形状と機能を理解するために重要です。それは、タンパク質の第三紀および四級構造につながるさらなる折りたたみと相互作用の基礎です。

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