1。基本を理解する
* 制限酵素： これらは、「認識部位」と呼ばれる特定の配列でDNAを切断する細菌酵素です。
* 認識サイト： 制限酵素が認識して結合するDNAの短いシーケンス（通常4-8塩基対）。
* サイト： 酵素がDNAを切断する認識シーケンス内の特定の位置。
2。識別の方法
* データベース検索：
* リベース： 制限酵素の最も包括的なデータベース（[https://rebase.neb.com/]（https://rebase.neb.com/）））。 酵素名、認識シーケンス、またはその他の基準で検索します。
* ニューイングランドBiolabs（NEB）： 認識サイト、バッファ要件などを含む、制限酵素カタログに関する広範な情報を提供します。
* Thermo Fisher Scientific： 包括的なオンラインカタログを備えた別の主要サプライヤー。
* 実験的決定：
* DNAシーケンス： 制限部位を含むと疑われる領域の正確なDNA配列を決定します。
* 制限ダイジェスト分析： 既知の制限酵素でDNAを消化し、ゲル電気泳動を使用して得られた断片を分析します。フラグメントのサイズと数は、制限サイトの存在と位置を示すことができます。
3。制限酵素を特定するための重要な情報
* 認識シーケンス： 酵素が認識する特定のDNA配列（例：5'-gaattc-3 '）。
* サイト： 酵素が切断する認識シーケンス内の正確な位置（たとえば、上記の例のGとAの間）。
* 切断パターン： 酵素がどのようにDNAを切断するか：
* 鈍い終了： オーバーハングなしできれいなカットを作成します。
* 粘着端： 補完的なシーケンスと組み合わせることができるオーバーハングでずらしたカットを作成します。
* バッファ要件： 酵素活性に必要な最適なpH、塩濃度、およびその他の条件。
4。制限酵素の選択
* ターゲットシーケンス： カットする特定のシーケンスを特定します。
* 望ましい終了： アプリケーションに鈍い端が必要か粘着性のあるかを決定します。
* 互換性： 選択した酵素が実験条件（バッファー、温度）と互換性があることを確認してください。
例：
シーケンス5'-GGATCC-3 'を認識し、粘着性の端を作成する制限酵素が必要だとしましょう。 Rebaseのようなデータベースを検索することにより、酵素BamHIにはこの認識シーケンスがあり、GとGの間にカットされ、粘着性の端が生成されることがわかります。
重要な注意： 特定の制限酵素に関する詳細情報については、メーカーが提供する製品情報シートを必ず参照してください。
