その理由は次のとおりです。
* 特異性： 各制限酵素は、特定のDNA配列のみを認識し、カットします。通常は4〜8塩基の長さです。 これらのシーケンスはしばしばパリンドロミックであり、同じ前方と後方を読み取ることを意味します。
* 認識サイトの可用性： これらの認識部位の存在と頻度は、異なるDNA配列間で大きく異なります。一部のDNAには特定の酵素のために多くの部位があるかもしれませんが、他のDNAには何もないかもしれません。
* DNA構造と修飾： 認識部位のアクセシビリティは、メチル化状態（DNA塩基上のメチル基の存在）を含むDNA分子の全体的な構造の影響を受ける可能性があります。一部の制限酵素はメチル化に敏感であり、認識部位がメチル化されている場合、DNAを削減しません。
要約すると、制限酵素の有効性は次のことに依存します：
1。 DNA配列内の特定の認識部位の存在。
2。 DNA構造と修正の影響を受ける可能性のある認識部位のアクセシビリティ。
したがって、特定のDNA配列に適切な制限酵素を使用するには、酵素の認識部位、そのメチル化感度、および標的DNAの特性を注意深く考慮し、知識が必要です。
