1。 DNA沈殿との干渉：
* 高い粘度： 植物細胞には、澱粉やセルロースなどの多糖類が含まれており、細胞溶解物の高い粘度に寄与しています。この粘度により、粘性マトリックス内に閉じ込められるため、DNAが溶液から沈殿することが困難になります。
* 共沈着： 炭水化物は、アルコール沈殿ステップ中にDNAと共沈み、高レベルの不純物を持つ汚染DNA製剤につながる可能性があります。
2。酵素反応の阻害：
* 酵素活性： 一部の炭水化物は、DNASEなどのDNA分離プロトコルで使用される酵素の活性を阻害する可能性があります。これにより、DNAの分解と収率が低下する可能性があります。
3。ダウンストリームアプリケーションの合併症：
* PCR阻害： 高レベルの炭水化物はPCR反応を阻害する可能性があり、さらなる分析のためにDNAを増幅することが困難になります。
* シーケンスの難しさ： 汚染炭水化物は、アーティファクトを作成し、シーケンスデータの品質を低下させることにより、DNAシーケンスを妨げる可能性があります。
炭水化物の影響を克服するための戦略：
* 機械的破壊： 均質化または研削方法は、細胞壁を効果的に分解し、粘性マトリックスからDNAを放出する可能性があります。
* 酵素消化： セルラーゼやペクチナーゼなどの酵素を使用して、多糖類を分解し、粘度を低下させることができます。
* 微分遠心分離： さまざまな速度での遠心分離は、サイズと密度に基づいてDNAを炭水化物から分離する可能性があります。
* 特殊なバッファ： 高塩濃度を含む緩衝液は、DNAとの炭水化物の共沈着を最小限に抑えるのに役立ちます。
* コマーシャルキット： 植物組織向けに特別に設計されたいくつかの市販のDNA分離キットは、炭水化物の効果を最小限に抑えるために最適化されたプロトコルと試薬を提供します。
これらの戦略を採用することにより、研究者は豊富な炭水化物によってもたらされる課題にもかかわらず、植物細胞から純粋で高品質のDNAを効果的に分離できます。
