(-n-c-c-)n
どこ:
* n アミド基の窒素原子を表します
* c アルファ炭素の炭素原子を表します
* c カルボニル基の炭素原子を表します
* n ポリペプチド鎖のアミノ酸の数を表します
この表現は、ポリペプチド骨格の繰り返しパターンを強調しています。これはアミド基の鎖です。 アルファカーボンにリンク およびカルボニル基 。
この表現にはサイドチェーンが含まれていないことに注意することが重要です 各アミノ酸にユニークな特性を与える可変部分であるアミノ酸の。
ポリペプチドバックボーンを表現できる他の方法を以下に示します。
* アミノ酸の略語の線形配列 、「Ala-Gly-Ser-Leu」のように
* ペプチド結合とアルファ炭素を示す図 、サイドチェーンが省略されています
* 3Dモデル ポリペプチド鎖の立体構造を示す
ポリペプチド骨格を表す最良の方法は、コンテキストと伝えたい情報に依存します。