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系統樹の数はどういう意味ですか?

系統樹の数字は、特定の木とその構築方法に応じて、異なる意味を持つことができます。ここにいくつかの一般的な解釈があります:

1。枝の長さ:

* 進化時間に比例します: 一部の木では、枝の長さは、2つの系統の発散以来過ぎてきた進化時間の推定量を表しています。より長い枝は、より多くの時間が経過していることを示しています。

* 遺伝的距離に比例します: 他の木では、枝の長さは種間の遺伝的距離に比例します。枝が長くなればなるほど、その端の種間の遺伝的違いが大きくなります。

* 任意: 一部の木は、枝の長さを使用して、時間や遺伝的距離を表すことなく、種間の関係を単に描写します。

2。ブートストラップサポート値:

* ノード配置に対する信頼: ブートストラップ値は、特定のノード(分岐点)がランダムに再サンプリングされたデータのセットで見つかった回数の割合を表します。値が高いほど、そのノードの配置に対する信頼性が高いことを示します。

* 例: 95%のブートストラップ値は、ノードが再サンプリングされたデータセットの95%で見つかったことを意味し、その存在に対する強力な統計的サポートを示唆しています。

3。事後確率:

* ベイジアン推論: ベイジアン推論を使用して生成された木では、データが与えられた場合、特定のノードが正しい可能性を示しています。

* 例: 0.95の事後確率は、ノードが正しく配置される可能性が95%あることを意味します。

4。ノードラベル:

* 種の名前: 特に多数の種を扱う場合、特定のノードにラベルを付けるために数値を使用することがあります。

* その他の情報: ノードラベルは、種の地質時代や特定の化石の名前など、他の情報を表す場合があります。

5。スケールバー:

* 時間/遺伝的変化の単位: スケールバーは、枝の長さによって表される時間または遺伝的変化の単位を示すために、系統樹に含まれることがよくあります。

特定の系統樹の数字の意味を理解するには、次のように重要です。

* フィギュアの凡例を読む: これは、多くの場合、数字の意味とツリーで使用されている他の記号を説明します。

* ツリー構造の方法を考慮してください: さまざまな方法(節約、距離、ベイジアンなど)は、さまざまなタイプの数値を使用する場合があります。

* 元の出版物を参照してください: 科学論文から木を調べている場合、著者は通常、メソッドセクションの数字の意味を説明します。

これらの詳細に注意を払うことにより、系統樹で提示された情報を解釈し、種とその多様化につながった進化の出来事との関係を理解することができます。

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