1。比較解剖学：
* 相同構造： 化石の解剖学的特徴を調べ、それらを生物と比較します。 骨構造、筋肉の付着、または臓器の配置の類似性は、構造が現代の動物で異なる機能を持っている場合でも、共通の祖先を示すことができます。
* 類似の構造： 化石の適応を生きている生物の適応と比較する。同様の機能を持つ構造は、根本的な解剖学が異なる構造は、環境圧力に対して生物が同様のソリューションを進化させた収束進化を示唆しています。
2。古生物学：
* 化石記録： 化石の地質学的文脈を研究します。化石が見つかった岩の層は、その年齢とそれが住んでいた環境についての手がかりを提供できます。これは、同様の環境に住んでいた潜在的な親relativeを絞り込むのに役立ちます。
* 化石継承： 岩層の化石のシーケンスを分析します。これにより、進化の傾向が明らかになり、絶滅と生物の間の関係を確立するのに役立ちます。
3。分子生物学：
* DNA分析： 化石にはDNAが保存されることはめったにありませんが、科学者は遺伝物質の断片を抽出することがあります。このDNAを生きた種と比較すると、進化的関係を信じられないほどの精度で確立できます。
* タンパク質分析： タンパク質は、特定の条件下で化石に保存できます。古代のタンパク質のアミノ酸配列と現代の生物のものを比較すると、進化的なつながりが明らかになる可能性があります。
4。系統解析：
* cladistics： この方法は、共有された派生特性（生物のグループに固有の特徴）を使用して、進化の木を構築します。化石は、その共有されたユニークな特性に基づいて、ツリー内に配置されます。
5。生物地理学：
* 分布パターン： 化石とその潜在的な親relativeの地理的分布を調べる。 化石や生物が地理的に近い場所にある場合、それはより緊密な進化的関係を示唆するかもしれません。
6。発達生物学：
* 胚発生： 化石の発達段階（保存されている場合）と生きている親relativeの段階を比較します。胚発生の類似性は、進化的関係に関する洞察を提供できます。
課題：
* 化石記録の不完全性： 化石記録は不完全であり、多くの絶滅した生物が代表されていないことを意味します。これにより、進化的関係を確実に再構築することが困難になります。
* 機能の解釈： 特徴が相同であるか類似しているかどうかを判断することは主観的であり、進化的関係の異なる解釈につながります。
* 限られたDNA/タンパク質データ： DNAとタンパク質は化石に保存されることはほとんどなく、これらの方法の有用性を制限します。
これらの課題にもかかわらず、科学者は常にその方法を改良し、学際的なアプローチを使用して、古代の生物の進化的関係に光を当てています。
