その理由は次のとおりです。
* 共有祖先： 分子研究、特にリボソームRNA遺伝子の分析は、古細菌と真核生物が細菌や真核生物よりも最近の共通の祖先を共有することを示しています。
* 同様の細胞構造： 古細菌と真核生物の両方は、以下を含む細菌よりも複雑な細胞構造を持っています。
* ヒストン： アルカエアと真核生物はどちらもヒストンタンパク質を使用して、細菌とは異なり、DNAをパッケージ化します。
* 同様の膜脂質： 古細菌と真核生物は、細菌とは異なる細胞膜にユニークな脂質構造を共有しています。
* 遺伝子発現機械： DNAをRNAに転写し、RNAをタンパク質に翻訳するメカニズムは、細菌と真核生物の間ではより古細菌と真核生物の間で類似しています。
簡単に言えば： 家系図を想像してみてください。古細菌と真核生物は、木の近くの枝になりますが、細菌はより遠い枝になります。
3つのドメイン（細菌、古細菌、真核生物）はすべて、古代の系統であり、何十億年も独立して進化してきたことを覚えておくことが重要です。 Archaeaは真核生物に近いが、それは直接的な「祖先」の関係ではない。 代わりに、彼らはずっと前に住んでいた共通の祖先を共有しています。
