アミノ酸には、基本的なグループであるアミノ基(-NH2)も含まれています。アミノ基は、アミノ酸に正味の正電荷を与える水素イオン(H+)を受け入れることができます。この正電荷は、アミノ酸に基本的な特性を与えるものです。
アミノ酸の酸性グループと塩基性グループ間のバランスは、全体的な電荷を決定します。ニュートラルなpHでは、カルボキシル基がアミノ基よりも酸性であるため、ほとんどのアミノ酸は正味の負電荷を持っています。ただし、リジンやアルギニンなどの一部のアミノ酸は、酸性グループよりも基本的なグループを持っているため、中性pHで正味の正電荷を持っています。