パンゲアの気候は地域ごとに異なりましたが、一般に次のように説明できます。
トロピカル:パンゲアの赤道領域は、豊富な降雨がある熱くて湿った気候によって特徴付けられました。この地域には、緑豊かな熱帯雨林やその他の熱帯生態系がありました。
温帯:パンゲアの中緯度は、中程度の温度と季節変動を伴う温帯気候を経験しました。これらの地域には、森林、草原、砂漠など、さまざまな植物や動物の生活がありました。
極:パンゲアの極地は寒くて乾燥しており、長くて暗い冬と短い涼しい夏がありました。これらの地域はツンドラ生態系の本拠地であり、冬の間は氷で覆われていた可能性があります。
パンゲアの気候も時間とともに変化しました。古生代後期に、地球は石炭紀の熱帯雨林崩壊として知られる地球温暖化の時代を経験しました。このイベントは、火山噴火や海底からのメタンの放出などの要因の組み合わせによって引き起こされました。その結果、温室効果ガスの増加により、地球温度の上昇と気候の変化が湿度から乾燥になりました。
中生代の時代に、パンゲアの気候は再び冷やし始めました。これは、超大陸の緩やかな分裂と新しい海盆地の形成によるものでした。結果として生じる表面積の増加により、海洋によってより多くの熱が吸収され、地球温度が低下しました。