気孔が開いている場合、空気は葉に入り、海綿状の葉肉の細胞間空間に拡散します。これらの空間は、葉全体に水と栄養素を輸送する木部および師部容器に接続されています。空気空間は、それぞれ光合成と呼吸に不可欠な二酸化炭素と酸素の拡散のための経路を提供します。
気孔の開閉は、ストーマを囲む特殊なセルであるガードセルによって制御されます。ガードセルがターギドになると、ストーマが開き、ガードセルが弛緩すると、ストーマが閉じられます。ガード細胞の濁度は、大気中の二酸化炭素の濃度、光強度、葉の水の状態など、いくつかの要因によって調節されています。