きらめき中に観察される色は、赤、青、緑に限定されませんが、黄色、オレンジ、さらには紫などの色合いを含むことができます。正確な色は、星の明るさ、空の位置、観察者の位置と大気条件など、いくつかの要因に依存します。
きらめく効果は、地平線の近くにある星の方が、より多くの雰囲気を通り抜ける必要があるため、より顕著です。光の経路が大気の乱流の影響を受けにくいため、空の中で高い星が安定しているように見えます。
星の実際の色は、きらめく効果ではなく表面温度によって決定されることは注目に値します。たとえば、赤い星は比較的涼しいですが、青い星は熱くなります。これらの色は星自体に固有のものであり、著しいきらめくことなく安定した大気条件で夜空を見るときに観察できます。