特定のDNA配列への結合（CIS調節要素）：
転写因子には、CIS調節要素と呼ばれる短いDNA配列を認識して結合できる特定のDNA結合ドメインが含まれています。これらの要素は、遺伝子のプロモーター領域または遺伝子から遠く離れて配置できるエンハンサー領域にあります。
クロマチン構造の変化：
DNAに結合すると、転写因子はクロマチン構造の変化を誘発する可能性があります。これは、核内でDNAをパッケージ化および調節するDNAおよびタンパク質の複合体です。転写因子は、クロマチンの基本単位であるヒストンタンパク質を修飾するクロマチンリモデリング複合体を動員することができます。これらの修飾により、クロマチン構造が緩和される可能性があり、転写にアクセスしやすくなります。
コアクチベーターとRNAポリメラーゼの動員：
転写因子は、コアクチベーターとして知られる他のタンパク質をプロモーター領域に補充できます。コアクチベーターは転写因子と相互作用し、DNAをRNAに転写する酵素であるRNAポリメラーゼの動員を支援します。 RNAポリメラーゼをプロモーター領域に持ち込むことにより、転写因子は遺伝子転写の開始を促進します。
他の転写因子およびシグナル伝達経路との相互作用：
転写因子は、しばしば他の転写因子やシグナル伝達経路と協調して遺伝子発現を調節します。それらは、タンパク質複合体を形成するか、シグナル伝達分子と相互作用して、さまざまな細胞シグナルを統合し、転写のためのDNAのアクセシビリティを調節することができます。
DNAメチル化とヒストン修飾の調節：
いくつかの転写因子は、クロマチン構造を変化させることにより遺伝子発現を調節する追加のメカニズムであるDNAメチル化パターンとヒストン修飾にも影響を与える可能性があります。これらのエピジェネティックな修飾を制御することにより、転写因子は遺伝子発現のためのDNAのアクセス性をさらに微調整できます。
まとめて、これらのメカニズムにより、マスターレギュレーターはDNAのアクセシビリティを制御し、さまざまな細胞シグナルと環境の手がかりに応じて遺伝子発現プログラムを調整できます。
