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酵素はどのように命名されていますか

酵素は、生物学的触媒として機能するタンパク質分子です。酵素には3つの特徴があります。まず、酵素の主な機能は、反応速度を高めることです。第二に、1 つの特定の酵素が 1 つの特定の基質に特異的に作用し、生成物を生成します。そして第三に、酵素は低活性から高活性へ、またはその逆に調節することができます.一部の酵素は、同じ反応を触媒することができます。それらはアイソザイムと呼ばれます。約 3,000 種類の酵素のユニークなセットが遺伝子的に合成されるようにプログラムされており、細胞に個性を与えています。 1 つの酵素が欠損すると、その影響は悲惨なものになります。酵素の命名には、一般名と系統名が使用されます。

この記事では、

1.酵素の名前の由来
2.酵素の命名規則
3. 酵素の分類レベル

酵素の名前の由来

一般に、酵素の一般名には、酵素が作用する基質の名前または酵素が触媒する化学反応を表す接頭辞が含まれています。接頭辞の後に接尾辞「ase」が続きます。この接尾辞は、化合物が酵素であることを示すだけです。たとえば、タンパク質をアミノ酸に分解する酵素は「プロテイナーゼ」または「プロテアーゼ」と呼ばれます。同様に、アルコールの脱水に関与する酵素は「アルコール脱水素酵素」と呼ばれます。ただし、レニン、ペプシン、トリプシンなど、もともと研究されていた酵素の名前を付けるときは、古い些細な名前が使用されます.酵素グルコシダーゼは 図 1 に示されています .マルトースから 2 つのグルコース分子への変換を触媒します。

図 1:グルコシダーゼ酵素

酵素が触媒する反応による体系的な命名法と酵素の分類は、国際生化学分子生物学連合 (IUBMB) によって開発されました。酵素の命名法と分類は、相互に密接に依存しているため、一緒に扱われます。

酵素の命名規則

酵素の命名法における 3 つの一般原則は、

1.サフィックス -ase 単一の触媒エンティティにのみ使用する必要があります。したがって、複数の酵素を含む系には適用できない。
2.
3.基本的な分類と命名法は、特定の酵素が触媒する反応に基づくべきである。酵素は、触媒される反応に応じてグループに分けられます。

酵素の機能的に関連するグループは、各グループにコード番号を割り当てることによって分類されます。コード番号には、ポイントで区切られた 4 つの要素と共に「EC」がプレフィックスとして付けられます。 4 つの要素には次の意味があります:

<オール>
  • 最初の数字は酵素のクラスを示しています。
  • 2 番目の数字は酵素のサブクラスを示します。
  • 4 番目の数字は、酵素のサブサブクラスを示します。
  • 5 番目の数字は、サブサブクラスの酵素のシリアル番号を示します。
  • 酵素の分類

    酵素分類のトップレベル、それらの名前と機能を下の表に示します。

    酵素クラス

    名前と機能

    EC1

    酸化還元酵素 :水の追加または除去

    EC2

    転送: 電子の移動

    EC3

    加水分解酵素: ラジカルの移動

    EC4

    リアーゼ: C-C 結合の分割または形成

    EC5

    イソメラーゼ: 分子の形状または構造の変更

    EC6

    リガーゼ: ATP または別の三リン酸のリン酸結合の加水分解による 2 つの分子の結合。

    表 1:酵素分類のトップレベル

    酵素は、この命名法で完全に指定できます。例えば、ヘキソキナーゼはトランスフェラーゼ (EC 2) であり、アルコール基 (EC 2.7.1) を含むヘキソース糖にリン酸基 (EC 2.7) を付加します。したがって、ヘキソキナーゼの命名法は EC 2.7.1.1 です。

    結論

    酵素は、触媒作用によって反応速度を高めます。それらは通常、作用する基質に基づいて命名されます。酵素は、触媒する反応の種類に基づいて名前も付けられます。酵素分類と組み合わせた体系的な命名法は、IUBMB によって開発されました。酵素は、体系的な酵素命名法によって 6 つのクラスに分類されます。

    参照:
    1.「酵素命名法」。 IUBMB 生化学命名法。 N.p.、n.d.ウェブ。 2017 年 5 月 20 日。
    2. 「酵素が触媒する反応による酵素の分類と命名法」。酵素分類。 N.p.、n.d.ウェブ。 2017 年 5 月 20 日。
    3.「生化学反応における酵素の役割」。酵素。 N.p.、n.d.ウェブ。 2017 年 5 月 20 日 .
    4.「酵素入門」命名と分類(酵素入門)。 N.p.、n.d.ウェブ。 2017 年 5 月 20 日。.

    画像提供:
    1. 「グルコシダーゼ酵素」Thomas Shafee 著 – 自身の作品 (CC BY-SA 4.0)、Commons Wikimedia 経由


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