ただし、この伝統的な理論には2つの重要な問題があります。
1-化石の証拠は、複雑な生活がこのように形成されなかったことを示しています。生物は化石記録に突然現れます - すでに複雑です。
2-種間のダーウィンの競争は、複雑さの進化を促進した種内の競争とその細胞の協力であったため、複雑さの進化の唯一の要因ではなかったでしょう。
複雑さの進化の裏返し理論は、これらの問題を克服します。
生物学的複雑さの「裏返し」進化のアイデアは、ゲノム自体が複雑さの進化を起こす可能性があることを示唆しています。
それには、種間ではなくゲノム内の利己的な遺伝的要素間の競争と協力が含まれます。
たとえば、 トランスポゾンは、ゲノム内を移動できる繰り返しのDNA配列です。トランスポゾンは、ゲノムに有益で有害な効果を提供し、進化に貢献できます。
さらに、ゲノムは、新しい遺伝的およびエピジェネティックな変化を自己組織化して作成する複雑なシステムです。これらの変化は、生物レベルで自然選択を受ける可能性のある新しい表現型を生じさせます。このインサイドアウトメカニズムは、複雑な生物学的システムの進化的起源について、より包括的な説明を提供します。