1。転写工場:
- 転写工場は、アクティブな転写が発生する核コンパートメントです。それらには、高濃度のRNAポリメラーゼII、転写因子、および遺伝子転写に関与する他のタンパク質が含まれています。
- 転写工場は、転写ハブまたは遺伝子クラスターと呼ばれる染色体の特定の領域と相互作用します。これらのハブは、高い遺伝子密度と座標調節によって特徴付けられます。
- 転写工場と染色体との相互作用は、複数の遺伝子の効率的な転写を同時に組織化および促進するのに役立ちます。
2。核斑点:
- 核斑点は、前癒着前RNA(前mRNA)スプライシング因子と小さな核リボ核プロテイン(SNRNP)で濃縮された核下構造です。
- 核斑点は、転写部位から出現する際に新生のRNA転写産物と相互作用します。それらは、イントロンが除去され、エクソンが結合されて成熟したmRNAを形成する前mRNAスプライシングのためのプラットフォームを提供します。
- 核斑点と染色体との相互作用により、RNA転写産物の処理と成熟が促進され、機能的mRNAの生成が確保されます。
3。核マトリックスアタッチメント領域(火星):
- 火星は、タンパク質に結合し、染色体と核マトリックスの間に付着を形成する特定のDNA配列です。
- 火星は核層などの核構造と相互作用し、核内で染色体の組織化を支援します。
- 火星と染色体の間の相互作用は、ゲノムの空間的組織に寄与し、遺伝子発現と核構造に影響を与えます。
4。クロマチンループとエンハンサーの相互作用:
- 分子クラスターは、調節要素(エンハンサー)と遺伝子プロモーター間のクロマチンループおよび長距離相互作用のハブとして機能することができます。
- エンハンサーは、遠くから遺伝子発現を制御するDNA配列です。それらはループし、プロモーターと物理的に相互作用して、遺伝子転写を強化または抑制することができます。
- 核斑点や転写工場などの分子クラスターは、エンハンサーとプロモーターが集まるプラットフォームとして機能し、長距離の調節相互作用を促進します。
要約すると、核内の分子クラスターは、転写工場、核斑点、火星、クロマチンループの形成など、さまざまなメカニズムを介して染色体と相互作用します。これらの相互作用は、遺伝子発現、RNA処理、および核内のゲノムの組織の調節に寄与します。