原生動物は伝統的に王国の生物系内の門として分類されていましたが、最近の研究では、それらがポリフライナス群であることが示されています 、つまり、彼らは単一の共通の祖先を共有していません。これは、それらが自然なグループ化ではなく、進化的関係に基づいて異なる門に再分類されていることを意味します。
単一の門の代わりに、原生動物は現在、次のような王国の門内のいくつかの異なる門に広がっています。
* AmoeBozoa: アメーバ
* foraminifera: 孔虫
* シリオフォラ: 繊毛
* apicomplexa: Apicomplexans
* radiolaria: 放射線虫
* diplomonadida: ディプロモナド
* Parabasalida: パラバサリド
したがって、「Phylum Protozoa」の科学名は、現代分類ではもはや有効な門ではないため、単一の科学名はありません。代わりに、以前は原生動物として分類されていたさまざまなグループは、現在、王国の原生生物内の複数の異なる門に広がっています。