アガロース濃度とゲル特性の関係の内訳は次のとおりです。
高アガロース濃度(例:2%):
* 小さな毛穴: アガロース濃度が高いと、細孔が小さく、より狭いゲルが作成されます。これは、小さな分子がタイトな空間をより簡単にナビゲートできるため、小さなDNAフラグメント(1000 bp未満)を分離するのに最適です。
* 高解像度: 断片が小さいため、細孔サイズが小さく、より鋭いバンドが生じ、より明確に移動します。
* 移行の遅い: 分子はより狭いスペースを絞る必要があり、移動速度が遅くなります。
低アガロース濃度(例:0.5%):
* 大きな毛穴: アガロース濃度が低いと、毛穴が大きい緩いゲルが作成されます。 これは、より大きな分子が細孔をより簡単に通過できるため、より大きなDNAフラグメント(10,000 bpを超える)を分離するのに最適です。
* 低解像度: 細孔サイズが大きいため、大きな断片はあまり分離されておらず、それほど明確ではないバンドにつながる可能性があります。
* 移行の高速: 耐性が少ないため、大きな分子がゲルをより速く移動します。
適切な濃度の選択:
理想的なアガロース濃度は、分離したい分子のサイズに依存します。
* 小さなDNAフラグメント: より高いアガロース濃度(1.5%-2%)を使用します。
* 大きなDNAフラグメント: より低いアガロース濃度(0.5%-1%)を使用します。
* 汎用: 幅広いDNAフラグメントには、標準濃度1%がよく使用されます。
考慮すべきその他の要因:
* アガロースのタイプ: さまざまなタイプのアガロースは、細孔のサイズと解像度に影響を与える可能性があります。
* バッファ: 電気泳動で使用されるバッファーは、移動率と解像度にも影響します。
* 電界: ゲル全体に適用される電圧は、移動速度にも影響を与える可能性があります。
要約すると、ゲル電気泳動におけるアガロースの濃度は、DNA断片の最適な解像度と分離を達成するために重要です。適切なアガロース濃度を慎重に選択することにより、希望する分子の効率的な分離を確保できます。