* 冗長性： 多くの場合、植物には同様の機能を実行する複数の遺伝子があります。 1つの遺伝子がノックアウトされると、別の遺伝子がその役割を引き継ぎ、突然変異の効果を隠す可能性があります。これは遺伝的冗長性として知られています。
* 条件効果： 突然変異は、特定の環境条件（ストレス、栄養不足、特定の温度など）の下でのみ効果をもたらす可能性があります。通常の状態では、植物は野生型と同一に見えるかもしれません。
* 微妙な表現型： 突然変異は、肉眼では容易に見えない生理学的プロセスの変化を引き起こす可能性があります。これには、代謝、ホルモンレベル、または遺伝子発現の変化が含まれる場合があります。
* 不完全なノックアウト： ノックアウトは、遺伝子の機能を完全に排除しない場合があります。まだ残留活性があるか、遺伝子が部分的にノックアウトされ、それほど深刻ではない効果をもたらす可能性があります。
* 発達段階： 表現型は、特定の発達段階でのみ表示される場合があります。たとえば、突然変異は種子の発芽に影響を与える可能性がありますが、成体植物には目に見える影響はありません。
隠された表現型を検出する方法：
ノックアウト変異体が目に見える表現型を示していなくても、さまざまな手法を使用して分子レベルで変化を検出することが可能です。
* 遺伝子発現分析： RNAシーケンスまたはQPCRを使用して、他の遺伝子の発現が変異体で変化しているかどうかを判断できます。
* タンパク質分析： ウエスタンブロッティングまたはその他の手法を使用して、タンパク質レベルとその活性を測定できます。
* 生化学的アッセイ： これらは、代謝経路または酵素活性の変化を測定するために使用できます。
* 生理学的研究： 特定の刺激に対する植物の反応を分析すること（例：ストレス、光、栄養素）は、変異体と野生型の微妙な違いを明らかにすることができます。
結論： ノックアウト変異体は野生型と同一に見えるかもしれませんが、変化がないという意味ではありません。 多くの場合、隠された表現型を明らかにし、遺伝子ノックアウトの結果を完全に理解するためには、さらなる調査が必要です。
