* 細菌： 多くの細菌、特に酸素不足の環境に住んでいる細菌は、嫌気性呼吸に依存しています。
* Archaea： 細菌のように、一部の古細菌は嫌気性呼吸を利用してエネルギーを生成します。
* 酵母： 酵母は、好気性と嫌気性呼吸の両方を実行できる一種の真菌であり、後者は発酵として知られています。
* 寄生虫： 寄生虫の回虫 *ascaris lumbricoides *のような一部の寄生生物は、宿主内の酸素不足環境で嫌気性呼吸を利用しています。
* 筋肉細胞（動物）： 激しい運動中、酸素供給が限られている場合、筋肉細胞は嫌気性呼吸（乳酸発酵）に切り替えてエネルギーを生成できます。
多くの生物は嫌気性呼吸を行うことはできますが、エネルギー生産の主要なモードではないことに注意することが重要です。ほとんどの生物は好気性呼吸を好みますが、これはエネルギー生産によりはるかに効率的です。
