これが系統型を作るものの内訳です:
* DNA配列に基づく: 系統型は、特定の遺伝子または遺伝領域のユニークな配列によって定義されます。通常、同じ系統型と見なされるために、シーケンスがどれほど類似している必要があるかについて特定のしきい値があります。
* 必ずしも種ではありません: 系統型は既知の種に対応する可能性がありますが、種として正式に分類されていない密接に関連する生物のグループを表すこともできます。
* 微生物群集の研究に役立つ: 系統型は、微生物の多様性のために従来の分類法がしばしば適用するのが難しいか不可能である微生物群集の研究において特に重要です。
ここに、系統型に関する重要なポイントがいくつかあります:
* それらは運用分類単位(OTU):です 系統型は、「運用分類単位」(OTU)という用語と同じ意味で使用されることがよくあります。これは、分析のための異なる単位と見なされる生物のグループを指します。
* さまざまな分類レベルで定義できます: 系統型は、選択した遺伝子と配列類似性のしきい値に応じて、種、属、またはより具体的な分類群を表す場合があります。
* 彼らは動的です: 系統型の定義は、より多くのシーケンスデータが利用可能になり、微生物の多様性の理解が進化するにつれて改訂できます。
要約: 系統型は、微生物の多様性と進化を理解するための強力なツールです。彼らは、従来の分類法が実行不可能な場合でも、研究者が遺伝的関係に基づいて生物をグループ化できるようにします。これは、個々の種を特定して分類することが課題になる可能性がある微生物群集の研究では特に重要です。