しかし、古細菌の細胞壁と細菌の細胞壁にはいくつかの重要な違いがあります。
* 構成： アルカエア細胞の壁は、通常、 pseudopeptidoglycanで作られています または s-layers 、細菌細胞壁はペプチドグリカンで作られています。
* 構造： シュードペプチドグリカンの化学構造は、ペプチドグリカンとはわずかに異なります。 S層は、格子に自己組織化するタンパク質または糖タンパク質で構成されています。
* 多様性： 細菌と比較して、古細菌で見られる細胞壁の種類には多様性があります。いくつかの古aeaは、多糖類などの細胞壁に追加の成分を持っている場合があります。
すべての古細菌が細胞壁を持っているわけではないことに注意することが重要です。 一部の種には細胞膜しかなく、一部の種には細胞壁の代わりにカプセルがあります。
