遺伝子合成につながる手順:
遺伝子合成は、いくつかの重要なステップを含む複雑なプロセスです。一般的なワークフローの内訳は次のとおりです。
1。設計とシーケンスの最適化:
* 遺伝子設計: 目的の遺伝子配列は、望ましいタンパク質、機能、またはその他の望ましい特性に基づいて決定されます。
* シーケンス最適化: 遺伝子配列は、選択した宿主生物のコドンの使用、発現レベル、およびタンパク質の安定性に最適化されています。これには、多くの場合、ホストの翻訳機械によって好まれることが知られている特定のコドンを組み込むことが含まれます。
2。オリゴヌクレオチド合成:
* 短いオリゴヌクレオチド: 最適化された遺伝子配列は、オリゴヌクレオチドと呼ばれるより小さな重複する断片に分割されます。これらは通常、長さ40〜60の塩基ペアです。
* 固相合成: オリゴヌクレオチドは、一度に1つのヌクレオチドを使用して、自動化されたシンセサイザーを使用して合成されます。 このプロセスは非常に正確で効率的です。
3。オリゴヌクレオチドのアセンブリ:
* フラグメントアセンブリ: 合成されたオリゴヌクレオチドは、さまざまな方法を使用して、より大きな断片に組み立てられます。
* PCRベースのアセンブリ: プライマーは、オリゴヌクレオチドの重複端までアニールするように設計されています。 PCR増幅は、フラグメントを一緒に結合します。
* ギブソンアセンブリ: この方法では、端が重複してDNAフラグメントをカットして結紮する特別な酵素を使用して、シームレスなアセンブリを達成します。
* ゴールデンゲートアセンブリ: この方法では、タイプII制限酵素を使用して、オリゴヌクレオチドの端に特定のオーバーハングを作成し、方向クローニングを可能にします。
4。遺伝子検証:
* シーケンス: 組み立てられた遺伝子は、精度を確保し、目的の配列が正しく合成されたことを確認するために配列決定されます。
5。クローニングと表現:
* クローニング: 検証された遺伝子は、適切なベクターにクローン化され、それを発現のために宿主生物に導入できます。
* 式: クローン化された遺伝子は、宿主生物で発現して、望ましいタンパク質を生成します。
6。タンパク質精製と特性評価:
* タンパク質精製: タンパク質は、アフィニティクロマトグラフィーやイオン交換クロマトグラフィーなどのさまざまな方法を使用して、宿主細胞抽出物から精製されます。
* タンパク質の特性評価: 精製されたタンパク質を分析して、その構造、機能、および特性を確認します。
追加メモ:
* 自動化とハイスループット: 最新の遺伝子合成技術は高度に自動化されており、同時に数百または数千の遺伝子を合成することができます。
* コスト: 近年、遺伝子合成のコストが大幅に減少しており、研究や産業用アプリケーションにとってよりアクセスしやすくなっています。
* アプリケーション: 遺伝子合成には、以下を含む多数のアプリケーションがあります。
* バイオ医薬品開発: 治療タンパク質とワクチンを産生します。
* 農業バイオテクノロジー: 病気耐性作物の開発と作物の収穫量の改善。
* 産業バイオテクノロジー: さまざまな用途向けの酵素およびその他のバイオ触媒を生成します。
* 基礎研究: 遺伝子機能、タンパク質構造、および進化の研究。
これらの手順に従うことにより、研究者と企業は、特定のシーケンスと機能を備えた合成遺伝子を作成し、幅広い分野で進歩を促進できます。