核酸シーケンス(DNA/RNA):
* 方法: 主にサンガーシーケンスに依存しています または次世代シーケンス(NGS) 。これらの方法には以下が含まれます。
* 断片化: DNA/RNAを小さな断片に分解します。
* チェーン終了: 修飾されたヌクレオチドを使用して、特定の位置でのDNA合成を停止します。
* 電気泳動: サイズごとにフラグメントを分離して、シーケンスを決定します。
* 情報: DNAまたはRNA分子でヌクレオチド(A、T、C、G)の正確な順序を提供します。
* 利点: 高スループット、比較的安価で、遺伝的変異を特定するのに適しています。
シーケンスタンパク質(ポリペプチド):
* 方法: 主に質量分析(MS)に依存しています 。この手法には次のものが含まれます。
* 断片化: タンパク質をより小さなペプチドに分解します。
* イオン化: ペプチドに電荷を与える。
* 質量対電荷比(m/z)決定: ペプチドの質量対電荷比の測定。
* データベース検索: m/z値を既知のタンパク質配列のデータベースに一致させます。
* 情報: タンパク質のアミノ酸配列を提供します。
* 利点: 非常に敏感で、翻訳後の修飾を特定することができ、複雑なタンパク質混合物を分析するために使用できます。
重要な違い:
* 方法論: タンパク質と核酸のシーケンスには、さまざまな技術が使用されています。
* 情報: 核酸配列決定によりヌクレオチドの順序が得られ、タンパク質配列決定によりアミノ酸の順序が得られます。
* 複雑さ: タンパク質シーケンスは一般により複雑であり、翻訳後の修飾の影響を受ける可能性があります。
要約すると、核酸とタンパク質の両方を配列決定できますが、得られた方法と情報は大きく異なります。