* 細菌： これらは原核生物であり、核や他の膜結合オルガネラを欠いていることを意味します。それらは非常に多様であり、有機物の分解やサイクリング栄養素の分解など、淡水生態系で重要な役割を果たしています。
* 藻類： これらは、単細胞または多細胞のいずれかである光合成生物です。いくつかの一般的な淡水藻類には、珪藻、緑色の藻類、青緑藻（シアノバクテリア）が含まれます。
* 原生動物： これらは、自由生活または寄生虫である可能性のある単一細胞の真核生物です。それらはしばしば従属栄養性であり、他の生物を消費することで食物を得ることを意味します。例には、アメーバ、パラメシウム、ユーグレナが含まれます。
これらは、淡水で見つけることができる多くの単細胞生物のほんの一例です。存在する特定の種類の生物は、水温、pH、栄養の入手可能性などの要因に依存します。
