さまざまな社会制度と慣行の機能的貢献に焦点を当てることにより、構造的機能主義は、これらの構造が不平等、抑圧、社会的不正を永続させる方法を見落とすかもしれません。既存の社会秩序から恩恵を受けたり、十分にサービスを受けたりしない可能性のある疎外されたグループや個人の経験と視点を説明することができません。
さらに、このアプローチは、あまりにも決定論的であると批判することができ、社会構造と制度には固定された不変の目的があることを意味します。これは、社会システムの動的で進化する性質、ならびに自分の社会的現実を形作る個人やグループの代理店と創造性を見落とすことができます。