1。ニック翻訳:
* 反応: この方法では、酵素 DNAポリメラーゼI を使用します DNA鎖のヌクレオチドを標識ヌクレオチドに置き換える。 dNase I を使用して、DNAに一本鎖切れ(ニック)を導入することで機能します 。次に、ポリメラーゼはニックをプライマーとして使用し、ギャップに標識されたヌクレオチドを組み込みます。
* 同位体: 一般的に使用される同位体は³²p-dctp です または³²p-datp 。
* 利点: 高い特異的活性(ラベル密度)を生成し、一本鎖DNAと二本鎖DNAの両方に適しています。
* 短所: 特定の酵素が必要であり、バッファー条件に敏感である可能性があります。
2。ランダムプライマーラベル:
* 反応: この方法では、短いランダムオリゴヌクレオチドプライマーと DNAポリメラーゼI を使用しています (Klenow Fragment)テンプレート鎖を相補的に新しいDNA鎖を合成する。 ポリメラーゼには、合成中に標識されたヌクレオチドが組み込まれています。
* 同位体: 一般的に使用される同位体は³²p-dctp です または³²p-datp 。
* 利点: 効率的で、単一鎖DNAと二本鎖DNAの両方のラベルを付けるために使用できます。
* 短所: ランダムプライマーの結合により、背景ラベルが導入される場合があります。
3。キナーゼでのエンドラベル:
* 反応: この方法では、ポリヌクレオチドキナーゼを使用します DNAフラグメントの5 '末端にリン酸基を追加する。リン酸基は、放射性同位体で標識されています。
* 同位体: 通常、³²p-atp または³P-ATP 使用されています。
* 利点: シンプルで簡単で、特に短いDNAフラグメントのラベル付けに役立ちます。
* 短所: DNAの5 '端にのみラベル付けされます。
4。 PCRラベル:
* 反応: この方法では、放射性DNTPS を使用することが含まれます (³²p-dctp など )PCR反応中。 これにより、ラベルが新しく合成されたDNA鎖に組み込まれています。
* 同位体: 一般的に使用される同位体は³²p-dctp です または³²p-datp 。
* 利点: 効率的で、特定のDNA配列にラベルを付けるために使用できます。
* 短所: 他の方法よりも効率が低く、高い特定のアクティビティを取得するのが難しい場合があります。
5。 in vitro転写:
* 反応: RNAポリメラーゼを使用します DNAテンプレートをRNAに転写します。 RNAは、合成中に放射性ヌクレオチドで標識されます。
* 同位体: 通常、³²p-utp または³⁵s-utp 。
* 利点: ハイブリダイゼーション研究のために高度に標識されたRNAプローブを生成できます。
* 短所: in vitro転写のための特殊な試薬と条件が必要です。
標識法の選択は、特定のアプリケーションと標識DNAの目的の特性に依存します。
注: 放射性同位体の使用は、安全上の懸念と非放射性標識法の利用可能性により、近年減少しています。 ただし、放射性標識は、特に感度と低存在量のターゲットを検出する能力について、特定のアプリケーションで依然としていくつかの利点があります。