DNA抽出で使用される化学物質：
1。溶解バッファー：
* 関数： 開いた細胞を破壊し、DNAを放出します。
* コンポーネント：
* 洗剤： 細胞膜を破壊します（例：SDS、Triton X-100）。
* 塩： 荷電分子を中和し、DNA（例えばNaCl）を安定化するのに役立ちます。
* Trisバッファー： 最適な酵素活性のためにpHを維持します。
* edta： マグネシウムのような二重のカチオンに結合するキレート剤は、DNASEによるDNA分解を防ぎます。
2。プロテイナーゼK：
* 関数： DNAに結合するヒストンを含むタンパク質を消化します。
* メカニズム： タンパク質内でペプチド結合を切断するセリンプロテアーゼ。
* 目的： DNAの分離と精製を妨げる可能性のあるタンパク質を除去します。
3。フェノール/クロロホルム：
* 関数： DNAをタンパク質や他の細胞の破片から分離します。
* メカニズム： フェノールはタンパク質を変性させ、それらを不溶性にしますが、クロロホルムは変性剤として作用し、水相と有機相を分離するのに役立ちます。
* 手順： 激しい揺れの後、混合物は3つの層に分かれます。
*最上層：DNAを含む水相。
*中間層：変性タンパク質を含む間期。
*下層：フェノール/クロロホルムを含む有機相。
* DNAは水層から回収されます。
4。エタノール/イソプロパノール：
* 関数： 溶液からDNAを沈殿させます。
* メカニズム： DNAは水に溶けますが、エタノールまたはイソプロパノールには不溶です。追加すると、これらのアルコールはDNAの溶解度を低下させ、溶液から沈殿させます。
* 手順： エタノールまたはイソプロパノールを添加した後、混合物を遠心分離してDNAペレットを収集します。
5。 TEバッファー：
* 関数： 抽出後にDNAを再懸濁および保存します。
* コンポーネント：
* Trisバッファー： 最適なDNA安定性のためにpHを維持します。
* edta： DNASEを阻害するキレート剤。
* 目的： DNAは無傷のままであり、貯蔵中の分解から保護されます。
6。 RNase A：
* 関数： RNA汚染を除去します。
* メカニズム： RNAを特異的に分解する酵素。
* 目的： PCRやシーケンスなどのダウンストリームアプリケーションの純粋なDNAサンプルを保証します。
注： 一部のプロトコルでは、溶解のためにグアニジン塩酸塩またはチオシアン酸グアニジンなどの他の化学物質、またはフェノール/クロロホルムの代わりにDNA結合と精製のためにシリカカラムを使用する場合があります。
