1。 2'-ヒドロキシル基:
* RNA: RNAには、リボース糖の2 '炭素に取り付けられたヒドロキシル基(OH)があります。このヒドロキシル基により、RNAは加水分解の影響を受けやすくなります 、ヌクレオチドをつなぐホスホジエステル結合が水によって分解されるプロセス。アルカリ条件では、この加水分解反応が加速されます。
* DNA: DNAには、この2'-ヒドロキシル基がなく、そのデオキシリボース糖のその位置に水素原子(H)のみがあります。これにより、Alkaline環境での加水分解に対してDNAがより耐性が高くなります。
2。基本構造と分解:
* RNA: RNAにウラシル(u)が存在すると、 deamination になりやすくなります 、ウラシルのアミノ基(-NH2)はカルボニル基(C =O)に変換されます。これはウラシルをシトシン(C)に変換し、潜在的に突然変異を引き起こします。 RNAとDNAの両方に脱アミノ化が発生する可能性がありますが、ウラシルの存在によりRNAでより一般的です。
* DNA: DNAには、ウラシルの代わりにチミン(T)が含まれています。チミンはウラシルよりも脱アミノ化傾向がなく、DNAのより大きな安定性に寄与しています。
3。二次構造:
* RNA: RNAの一本鎖の性質により、ヘアピンループ、ステムループ、擬似ノットなど、さまざまな複雑な二次構造を形成できます。これらの構造は非常に脆弱であり、アルカリ性の状態によって破壊される可能性があり、RNAの分解にさらに寄与します。
* DNA: 補完的な塩基間の水素結合を備えたDNAの二本鎖構造は、アルカリの破壊に対する安定性と耐性を高めます。
要約:
2'-ヒドロキシル基の存在、ウラシルの固有の不安定性、およびより複雑で脆弱な二次構造により、RNAはDNAと比較してアルカリ条件での分解に対してはるかに脆弱になります。