* 浮力密度: これは、分子(DNAのような)が密度勾配に浮かぶ密度を指します。これは主に cesium cesium(cscl)密度勾配遠心分離などの技術で使用されています。 。 異なる塩基組成のDNA分子は、わずかに異なる浮力密度を持ち、その分離を可能にします。
* 融解温度(TM): これは、DNA二重らせんの半分が変性されている温度(単一の鎖に分離)です。主にベース構成の影響を受けます DNAの、より高いGC含有量が高いTMにつながります。
接続:
浮力密度と融解温度は別々の特性ですが、どちらもDNAのベース組成に依存します。
* より高いGC含有量: より高い浮力密度につながります(G-C結合はA-T結合よりも強いため)および 融解温度が高くなります(二重らせんの強度が増加しているため)。
* GCコンテンツの低い: 結果として、傾斜密度が低くなり、融解温度が低くなります。
したがって、間接的な関係があります: DNAフラグメントの浮力密度を知ることで、GC含有量の兆候が得られると、融解温度を推定するのに役立ちます。
重要な注意: 浮力密度と融解温度は、DNAの挙動に影響を与える2つの要因にすぎません。他の要因も次のような役割を果たすことができます。
* DNA長: より長いDNA分子はTMが高くなっています。
* イオン強度: 塩濃度が高いほどTMが増加します。
* ph: 極端なpH値は、DNAの安定性に影響を与える可能性があります。
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