光学顕微鏡：
* ステレオ顕微鏡（分析顕微鏡）： この顕微鏡は、オブジェクトの3次元ビューを提供し、昆虫、植物、回路基板などの大きな標本を調べるのに理想的です。 2つの個別の目的レンズを使用して、立体画像を作成します。
* 共焦点顕微鏡： この顕微鏡では、レーザーとピンホールを使用してサンプルを照らしてスキャンし、薄いスライスの詳細な画像を作成します。高解像度の3D画像を作成し、焦点が合っていない光からぼやけることを減らすことができます。
* 蛍光顕微鏡： この顕微鏡は、蛍光色素を使用して、試験片内の特定の構造を照らします。それは非常に敏感であり、生細胞とそのプロセスを研究するために使用できます。
* 相コントラスト顕微鏡： この顕微鏡は、標本を通過する光の位相を操作することにより、透明なオブジェクトのコントラストを強化します。これは、生細胞とその内部構造を観察するのに役立ちます。
* 偏光顕微鏡： この顕微鏡は、偏光を使用して、結晶や繊維などの複屈折（二重屈折）を示す標本を調べます。
電子顕微鏡：
* 透過電子顕微鏡（TEM）： この顕微鏡は、電子のビームを使用して、標本の非常に薄いスライスの画像を作成します。非常に高い解像度を提供し、細胞構造の細かい詳細を明らかにすることができます。
* 走査型電子顕微鏡（SEM）： この顕微鏡は、電子の焦点を合わせたビームでサンプルをスキャンします。標本の表面の3D画像を生成し、その地形と組成を明らかにします。
その他の特殊な顕微鏡：
* 原子間顕微鏡（AFM）： この顕微鏡は、鋭い先端を使用して表面をスキャンし、その地形の画像を作成します。個々の原子と分子を解決できます。
* スキャントンネル顕微鏡（STM）： この顕微鏡は、鋭い先端を使用して、導電性材料の表面をプローブします。個々の原子と分子を解決し、それらを操作するために使用できます。
* X線顕微鏡： この顕微鏡は、X線を使用して標本を画像化し、内部構造と元素組成に関する情報を提供します。
* 近いフィールドスキャン光学顕微鏡（NSOM）： この顕微鏡では、小さな開口部を備えたプローブを使用して、サンプルを照らしてスキャンします。従来の光学顕微鏡よりも高い解像度を提供します。
顕微鏡の選択は、対処される特定の研究質問、標本のサイズと性質、および必要な詳細レベルに依存します。各顕微鏡タイプは独自の利点と制限を提供し、科学者が前例のない詳細で顕微鏡の世界を探索できるようにします。
